两者存在实质上的区别。乳腺增生主要是乳腺结构紊乱，乳腺囊肿说明体内肿块呈囊样增生。乳腺囊肿一般会手术切除，而乳腺增生可以保守药物治疗，物理治疗都是可以控制病情的进一步发展。
乳腺囊肿，里面是液体，质地韧，有弹性，圆形或椭圆形，乳腺增生是正常的生理过程，周期性乳房疼痛，乳房肿块，少数人有乳头溢液，乳腺增生是良性病变，和体内激素是有关，有周期性的乳房疼痛，乳房有包块儿，没有疼痛的现象。
乳腺增生主要是因为体内雌激素水平高引起的，典型的症状就是会引起乳房胀痛，乳房囊肿主要是因为乳腺导管扩张引起的。乳房内的小囊肿，一般不会引起症状，应该到医院进行检查，进一步治疗。
乳腺增生是乳房乳腺小叶有增生变化的一类疾病，而乳腺囊肿是属于乳房有感染的情况存在的症状，导致局部有囊肿的变化，治疗办法也是不一样的，乳腺增生主要是用活血化瘀的中药，而乳腺囊肿需要做积极的抗炎治疗，乳腺增生主要发生于育龄期的女性，表现为月经来潮之前，乳房不同程度的胀痛，月经来潮之后，会有所减轻或者是消失。由于乳腺疾病与情绪有一定的关系，所以注意情绪的调节，避免愤怒等不良情绪影响。
乳腺囊肿形成的肿块大多呈圆形或卵圆形，边界清晰，可自由动推动，有明显的囊性感，其中含有无色、或淡黄色的液体。乳房胀痛感与月经周期关系不大。而乳腺增生形成的肿块大小不一，可呈片状、结节状、条索状等，其中以片状为多见，与周围乳腺组织边界不明显，质地中等或稍硬。乳房的胀痛在月经来潮前显著，月经后减轻或消失。
是一个非常常见的良性病变，主要是进行药物治疗，对于严重的也需要考虑手术治疗，避免进一步发生病变的可能，平时要注意保持心情舒畅，饮食主要是避免吃含激素多的食物。注意保持乐观的心态，佩戴合适的胸罩，以免过紧影响局部血液循环。
