一般来说，孩子发烧后肚子疼主要是以下原因。具体分析如下：
孩子发烧后肚子疼，应考虑是由急性感染引起的肠痉挛性病变，此时应根据小儿有无明显的呕吐、拉肚子等表现，若有，应怀疑为急性胃肠炎，此类病症可口服抗生素，多喝水，缓解病情。但若无明显的腹痛、呕吐等表现，应考虑腹中其它器官的炎症，比如胰腺、胆囊等，需要做B超的辅助检查。
需要注意的是，家长需要观察孩子体温、脉象、大小便、出汗等情况的变化。
宝宝发烧如果体温是38℃以下，这样的体温一般可以通过物理降温，可以给宝宝贴退热贴，或者是用温水擦拭腋窝、大腿根、脖子这些地方，再一个就是给宝宝多喝水。宝宝既发烧又肚子疼，肚子疼多半就是考虑肠系膜淋巴结炎导致的。这种需要给宝宝做个肠系膜的彩超看一下。
通常和呼吸道感染或者肠道感染有关系，多为病毒或细菌感染所致。是由于饮食不节或不洁导致的因素。因为孩子机体免疫比较差，所以肠胃发炎很容易导致自身机体出现排斥反应，出现发热的现象。
小孩感冒发烧肚子疼多是由胃肠型感冒引起的，发烧首先需要查血常规、CRP，看看有没有细菌或者病毒感染再进一步用药。如果体温小于38.5摄氏度物理降温即可，如果体温大于38.5摄氏度需要口服退烧药，可以吃美林退烧，另外可以吃藿香正气胶囊。这段时间注意保暖，多喝热水，忌辛辣刺激食物，吃清淡容易消化的食物。
宝宝发烧肚子疼还吐了考虑是急性肠胃炎，急性胃肠炎是一种十分常见的急性胃肠道疾病，发病急而恢复也较快，常表现为恶心、呕吐、腹痛、腹泻等。婴幼儿胃肠道功能比较差，对外界感染的抵抗力低，稍有不适就容易发病。小儿肠炎多因不洁东西所引起，故预防最要紧的是食物之清洁及保存安全。
通常情况下，孩子发烧肚子疼一般考虑为小儿急性肠系膜淋巴结炎。
急性肠系膜淋巴结炎属于病毒感染引起，常合并、继发于上呼吸道感以后，比较容易反复发作，患儿可伴有发热症状。如果经过彩超检查发现肠系膜淋巴结有肿大，在症状较重者的患者，可以通过静脉输抗生素治疗，也可以口服胃肠安丸来缓解症状。并且如果确诊为急性肠系膜淋巴结炎，建议一定要注意休息，不要从事剧烈活动、运动。