一般去肛肠科进行系统治疗，平时要多补充粗纤维食物，保持大便通畅，温水坐浴，肛门保持局部卫生，内裤及时更换和暴晒。肛瘘是一种肛管直肠间隙感染的现象，一般和肛周脓肿反复发作有关系。可以出现多个肛门多个瘘口和大便形成。可以采取低位挂线治疗。
具体的时间要根据个人的体质情况来定，因为每个人的体质不同，对药物的吸收程度不同，所以说时间也会有所差异，术后一定要多喝水，尽量别多吃水果蔬菜保持大便通畅。保持充足的休息时间。
肛瘘挂线掉落之后，伤口一般很快就会愈合了，只要做好换药和清洗的工作，没有发炎的情况，两个礼拜左右就能够慢慢愈合了，在掉线之后一定要注意每天都保持伤口清洁干燥，否则是会出现发炎，如果一旦发炎应该尽快治疗。
挂线疗法是利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械性压迫作用，使结扎处组织发生血运障碍坏死，以缓慢切开肛瘘，炎症反应引起的纤维化使切断的肌肉与周围组织粘连，肌肉不会收缩过多且逐渐愈合，还可防止大便失禁。
肛瘘一般挂线疗法比较好，但是时间较长，一般于7-10天开始掉线，复杂高位肛瘘可能需要时间更长点一般是2-3周左右。术后需要注意：1、应卧床休息或减少活动，避免局部过度摩擦。2、注意肛门局部卫生：每日睡前便后用温水清洗肛门，勤换内裤。3、忌油腻荤腥食物，少食多餐，减轻肠胃负担。4、平素有嗜烟、嗜酒、嗜茶习惯时，应努力纠正。5、不要坐卧湿地，也不要在草地。
