耳廓畸形的病因尚不十分明确，未能发现特殊的确定致病因素，从环境和遗传方面的研究都表明有多种因素可能会导致畸形的发生。
除了遗传因素外，环境因素，包括生物、理化和心理因素也可能会导致耳廓畸形：
1、孕初期感染致病性病毒：包括感冒病毒、水痘带状疱疹病毒等。
2、母亲患免疫性疾病和糖尿病。
3、辐射及环境污染。
4、化学因素：怀孕早期使用激素类、磺胺类、部分中草药、抗病毒类药物、庆大霉素、链霉素、四环素、白霉素等抗生素。
5、孕期经常接触烟酒也是易感因素。
6、怀孕初期受到精神刺激也是诱发因素之一。
婴儿多指畸形主要跟遗传因素有关，具体如下：
父母家庭成员中有多指畸形病人，子女多指畸形的概率就会增加。孕期母亲受到电离辐射，如X线、CT检查等，可能损伤胚胎。孕期母亲用了致畸药物也会导致多指畸形。母亲生活习惯不好，如吸烟、喝酒容易导致多指畸形概率增加。腹部创伤导致胎盘受损也会使多指畸形发生的概率增加。
脊柱畸形的病因有很多，有些病因是明确的，比如先天性的脊柱侧弯，是在母亲的怀孕期间椎体发育不完全，出现半椎体，或者是椎体分解不全造成的畸形，后天性的脊柱畸形最大的一部分是特发性脊柱畸形，这一部分的病因是不明确的。
引起小儿畸形的原因有很多种，需要确认在怀孕期间是不是有抽烟喝酒的习惯，这对孩子造成畸形的情况非常多的，怀孕的期间吃药物过多，也会使胎儿出现畸形，也有可能是近亲结婚引起的畸形，一定要治疗。
畸形精子症是导致男性不育的原因之一，患上此症在临床上会出现倦怠乏力，纳食不香，腹胀闷，或腰膝酸软，伴有精姬静脉曲张可有睾丸坠胀表现。对于畸形精子，在受孕方面，几率是比较小的。主要是看畸形精子的比例有多大。越大，出现受孕的几率也就越小了。所以，需要去专科医院进行检查，对症治疗。
