病情严重的小三阳，治疗时首先要服用保肝药物；其次，做好基本治疗，如注意休息、清淡饮食；再就是要针对病因进行治疗；小三阳的病情相对稳定，不发展到肝硬化或肝肿瘤者，只需定期检查，长期观察。
小三阳首先应检测肝功能，化验血中HBV-DNA含量及前C基因变异情况，并通过必要的肝活检来正确分析这种“小三阳”是否需要采取治疗措施。一般而言，如果肝功能正常，HBV-DNA阴性，不需要治疗，半年定期复查。如果肝功能异常，HBV-DNA阳性，则需要治疗。
乙肝小三阳是乙肝的一种病理改变，是一个相对平稳的时期，患者的肝脏功能都是很好的，没有任何的征兆。
不过，乙型三阳患者的甲胎蛋白升高，很有可能是肝内胆管结石，建议做彩色超声检查，排除胆管结石的可能性。如果是因为乙肝的情况，比如突然的肝衰竭、重症肝炎、肝硬化等，或者是恶性的，要做详细的诊断，然后尽快治疗，比如手术、化疗等。
乙肝小三阳是指乙肝表面抗原阳性，乙肝e抗体阳性，乙肝核心抗体阳性，多具有传染性，还需检查肝功能，出现肝功能异常者需要积极治疗，多出现疲劳倦怠感，食欲不振，肝区隐痛等症。就诊传染病科检查治疗，注意休息劳逸结合，避免肝毒性药物，定期复诊。
小三阳一般是不可能，不太可能，但是也有的病人可以完全，但毕竟是极少数，大部分病人是成为慢性乙肝，成为健康携带者，只要定期复查肝功能，肝功能正常的，也不需要治疗。
