治疗癌症的主要方法有手术、放疗和化疗三种方式。三种方式可以交叉使用，有的需要在手术之前进行放疗或者化疗以改善肿瘤的大小，改善局部的症状；有的需要在手术切除之后再结合肿瘤的分期进行放疗或化疗治疗。
可以用放射治疗。肛门部鳞状细胞癌和基底细胞癌，对放射线甚为敏感。根据患者的全身情况及肿瘤的局部情况，可选择使用X线体外放疗、镭放疗、钴放疗、电子加速器放疗，也可结合手术治疗。在术前应用可提高切除率，术后应用则可减少复发，提高疗效。
肛管癌病人的临床症状普遍有肛门疼痛、排便不净、增加排便次数、便中有脓血或者黏液。肛管癌是一种早期不会有明显症状的疾病。由于肿块处于肛管部位且为不太规则的形状，因此出血的概率较大，容易引起患者便血，当肿块逐渐长大后，会对肠道造成较为严重的堵塞，引起患者困难排便问题，此时患者会有排便不净、肛周疼痛的感觉。
肛管癌病人的临床症状普遍有肛门疼痛、排便不净、增加排便次数、便中有脓血或者黏液。肛管癌是一种早期不会有明显症状的疾病。由于肿块处于肛管部位且为不太规则的形状，因此出血的概率较大，容易引起患者便血，当肿块逐渐长大后，会对肠道造成较为严重的堵塞，引起患者困难排便问题，此时患者会有排便不净、肛周疼痛的感觉。
发生于肛管的恶性肿瘤称之为肛管癌，由于肛管的神经支配受脊神经支配，所以持续性疼痛为肛管癌的主要表现。排便时或便后疼痛加剧，早期会有少量的便血，随着病情加重便血量逐渐增多，大便习惯会有改变，排便次数增多且有便后不尽感。