体积较小不严重，体积大是严重的。脑囊肿的严重程度主要和大小和生长位置有关。体积较小没有不适这类脑囊肿是不严重的，脑囊肿体积比较大，有头痛、恶心、肢体功能障碍，严重者会出现癫痫，相对比较严重，需要手术治疗。
蝶窦囊肿最易累及视神经，影响患者视力，早期手术有利于视力的恢复。鼻内窥镜下蝶窦囊肿摘除术有损伤小，出血少，痛苦轻，手术时间短，安全，术后恢复快等优点。蝶窦囊肿是一种良性肿瘤样病变，主要的症状为头痛。
腱鞘囊肿手术治疗后还有可能会复发。
腱鞘囊肿的产生与工作和体育相关，如果经常屈伸腕关节，很可能导致腕部的腱鞘囊肿和腱鞘炎，反复的屈伸踝关节和反复的跑步等疲劳的运动都会导致腱鞘囊肿或腱鞘的感染，在手术完全的切除之后，在一段时间之后，如果进行一系列的工作和锻炼，不小心，仍然是疲劳的反复的运动，导致了肌肉的反复屈伸，导致了局部的炎症，从而导致了囊肿的产生。所以在做完了腱鞘囊肿之后，不注意经常做重复的动作，再做疲劳的活动也会导致肌腱鞘囊肿的再次出现。
骶管囊肿这个一般手术恢复需要时间在30天-45天左右，手术都是有一定风险的，可能损伤囊肿周围神经，这个大多术后恢复不错，注意术后护理，对于有症状者应在除外椎间盘突出、椎管狭窄或骶管内肿瘤的前提下，积极手术治疗，可以去当地医院检查治疗。
肝囊肿手术主要是在腹腔镜下开创引流术，主要是将肝囊肿的囊壁打开，让囊液流出来达到治疗的目的，还有是肝囊肿的穿刺引流术，穿刺引流术容易囊肿复发，比开创引流术效果要差一些。
卵巢囊肿的手术治疗方法包括腹腔镜手术与开腹手术两种手术途径。开腹手术包括开腹的卵巢囊肿剥除术以及开腹的患侧附件切除术；腹腔镜手术包括腹腔镜下卵巢囊肿剥除术以及腹腔镜下患侧附件切除术。对于年轻、有生育要求的病人，卵巢囊肿一般选择腹腔镜卵巢囊肿剥除术或者开腹卵巢囊肿剥除术。对于年龄比较大、没有生育要求、或者绝经后的女性，可以选择开腹的患侧附件切除术或者腹腔镜下患侧附件切除手术。
