乙肝的病毒携带者，如满足了干扰素的抗病毒治疗，应主动应用干扰素进行抗病毒治疗，但也有其不足之处，例如肝硬化失代偿期肝功能不好的患者，以及引起自身免疫有关的病症，例如甲状腺炎，自身免疫性的肝炎等。
干扰素的抗菌疗法有很大的优势，最大的优势就是可以停止使用。对于一些乙肝表面抗原呈阴性，但表面抗原含量偏低的患者，可以通过转阴来完成乙肝表面抗原的转阴，从而使乙肝病毒转阴，这个几率在30%以上，并且在转移后可以停止服用，周期比服用的护肝类的药物要快一些，大约需要一年的时间。
干扰素治好乙肝的概率在30％左右。干扰素治疗乙肝，能够有效的抑制病毒的产生，治好后复发的概率也比较低，但是患者需要长期注射，部分患者的病情会逐渐好转，直到治好。
丙型肝炎治疗方面最常用的药物，这种药物的副作用确实是很多，对骨髓有抑制性的作用，可以使白细胞血小板一过性的下降，也可以使转氨酶一过性升高，长期用这种药物也有可能会出现脱发，神经方面的一些症状，可以诱发自身免疫性疾病的发生。
用干扰素一般不会影响月经。
干扰素具有增强机体免疫功能，能够有效地排除体内的有害物质，对多种类型的病毒进行辅助处理。高度危险HPV病毒的患者，在TCT检查中没有发现任何问题，在免疫力下降的情况下，可以使用干扰素栓进行阴道上药。干扰素栓不会对女性的卵巢产生任何的干扰，也不会对月经造成任何的负面影响。如果服用了干扰素栓会推迟来潮，那么就需要怀疑是否有别的因素，例如妊娠、压力等。
干扰素一般不会影响月经。由于干扰素被用于提高免疫力，常用于抗病毒治疗，但若再与其他药物合用，由于药物间的相互作用，很可能对月经产生影响，但是干扰素自身并不影响月经。在临床中有许多因素可以影响月经，如妊娠。如果病人有月经不规律，若判断病人未妊娠，很可能月经失调了，由于干扰素对月经没有影响。另外还有一个原因就是患者服用了抗生素类或者激素类等药品。若病人服药后，再一次同房，由此引起月经不调，应和干扰素关系不大。
