月经结束后第三天同房是否会怀孕，要看月经期是几天，如果在七天内，月经干净后第三天是安全期同房基本是不会怀孕的，但也不能完全排除，也有排卵提前的可能。如果实在担心怀孕，还没有超过72小时，可以吃紧急避孕药进行补救避孕。
女性在来潮后三日有性生活是有可能怀孕的。
原因是在排卵前2-3天至排卵后24个钟头发生性关系，女性月经周期较少，有可能导致女性出现妊娠。女性经期延迟一星期，还没有来潮，可以去看一下人绒毛膜促性腺激素，如果检测结果为妊娠，若为妊娠，则要进行平腔彩超，确定是否存在子宫内孕或宫外孕，是否存在原有的心脏跳动。
月经干净后3天属于安全期，性生活时没有采取避孕措施也不会怀孕，但安全期不是绝对的安全，因为很多原因(如精神因素，疾病，药物，环境等）都可以影响女性的排卵.如果近期没有生育的打算，性生活时采取有效的避孕措施，以免导致意外怀孕。
一般来说，月经干净7-15天同房容易怀孕。具体分析如下：
通常排卵期同房怀孕几率最高，如果平时月经周期比较规律，很排卵日期一般在下次月经来潮前的14天左右，通常将排卵日的前5天和后4天，连同排卵日在内共10天称为排卵期。因此月经干净7-15天同房容易怀孕。备孕时心理压力不要太大，避免过度的情绪波动。
月经干净后第1天同房，存在一部分怀孕的可能性。例如有的女性月经周期比较短，在21天左右，而月经经期却比较长，在7天左右，月经干净后第1天就没有安全期，直接进入排卵期，如果没有避孕措施性生活，就有怀孕的概率性。
在月经干净后的第4天发生同房，并且没有预防措施那么怀孕的可能性不会很大，这个时候是安全期，在排卵期受孕的几率比较大，排卵期一般在月经后的第10天到15天之内。如果还没考虑好要小孩那么比较好的方式，就是采取避孕措施。