主要有两种方式，一种创伤比较小，用穿刺抽液的方式来进行，是用细针在B超临床引导的情况下，达到肾囊肿的部位，然后穿刺抽液，这种方式需要了解肾囊肿的部位，此外如果肾囊肿部位不佳，无法穿刺，则需要外科手术治疗，可以做一个肾脏彩超检查了解肾囊肿的部位，为手术的选择方式的选择提供更好的资料。
如果囊肿体积不大，对身体健康没有什么危害，和正常人是一样的。如果囊肿体积大于5cm或者有压迫症状，可以通过囊液穿刺抽吸术并囊壁硬化术治疗，属于非常小的手术，预后非常好，对身体没有损害，不影响生存，如果囊肿体积过大，大于10cm，通过手术治疗也是可以完全治愈的。
肾囊肿如果较小，没有出现肾功能异常，病情需要可以用三七粉，三七粉有活血化瘀的效果，对于肾囊肿效果不大，不需要吃，对于小的肾囊肿，无症状时不需要做任何治疗，但要定期复查。
患有肾囊肿的人不能饮酒，可以多喝温热的白开水，勤排尿，不要吃辛辣刺激性的食物。肾囊肿要根据囊肿的具体大小来制定相应的诊治，如果囊肿体积比较小，在5cm以下的肾囊肿可以暂时不用诊治。
孕妇出现肾囊肿是不太严重的一种病症。但是建议密切观察。
肾囊肿，顾名思义，就是肾实质的一种囊性病变，通常为良性病变，若肾囊肿的体积很小，只要经常复查。若患者出现血尿、蛋白尿等肾功能损害时，就应该到医院就诊。孕妇若出现肾囊肿，无明显症状，可暂时不需要办理，甚至更大，亦可于投产后处理。建议定期进行产前检查，明确胎儿和孕妇的身体状态。
