首先应确诊为化脓性感染，形成脓腔，结核性冷脓肿无混合性感染时，不做切开引流。保证脓腔引流通畅，切口需做在脓腔的最低部位，切口必须够大，可做一到两个对口引流。切开时不能损坏重要血管、神经，颜面部切开引流应注意尽可能不损坏面容。切口部位的选择，注意愈合的瘢痕不影响该处的功能，尤其是手指的触觉，手的握力，足的负重及关节的运动功能等。
肛周脓肿切开排脓术后会形成肛瘘，但是几率非常的小，如果是去正规公立三甲及以上医院的肛肠科进行的手术，则效果更好一些，而且术后需要注意不要吃辛辣刺激性的食物，养成定时排便的习惯，避免大便干燥。
肛周脓肿切开引流后，换药处理，而且要看脓腔的情况，而且定期进行每天坐浴治疗，换药和塞油纱布要持续到脓腔变浅基本消失，有腔隙就要塞油纱布引流，防止假性愈合。直至伤口完全愈合。保持局部清洁卫生，勤换敷料等。
肛周脓肿切开排脓是会痛的，不过会有麻醉的，是不会感觉到痛的。随着脓液排出，疼痛也逐渐缓解，最后炎症完全消退。病情较轻时，脓液可以自然流出。肛周脓肿多数情况下会有疼痛剧烈，需要切开引流。除非病情很轻，病灶一般都一天比一天扩大，因此应尽早切开排脓。
脓肿切开引流术是处理脓肿的一种方法，局部脓肿化脓后需要切开引流，引流后还需继续使用药垫塞紧创面，让创面在底部逐步愈合，脓肿切开引流并不能使脓肿的包膜完全消除，还会有复发的几率，再者脓肿愈合还是有脓肿，需考虑脓液没有完全清除干净。
一般术后一个月左右伤口可以长好。脓肿术后需要每天肛门用清热解毒、然后摸药膏，定期换药。平时注意饮食，禁食辛辣刺激性食物，多吃水果蔬菜，保持大便通畅。便秘、腹泻都有可能造成伤口水肿。一般术后十天左右伤口就没有什么感觉了，可以恢复上班，伤口长好需要一个月左右。
