主要是因为子宫颈的长期慢性炎症刺激，使宫颈充血水肿，宫颈腺体和间质发生增生，而导致的子宫颈不同程度的肥大。子宫颈表面是鳞状上皮，还有柱状上皮，在炎症刺激以后，柱状上皮会覆盖鳞状上皮，鳞状上皮反复的增生，就会形成慢性炎症不典型的增生状。
川崎病患者大多有较好的预后，部分患者能自行康复。不典型的川崎病，最大的危险在于它会导致冠状动脉的扩张，如果不是这样的话，它是可以自行愈合的。不典型的川崎病也可以通过适当的治疗来恢复。
但也有少数儿童，出现冠状动脉瘤的几率在15-30%之间。要是冠状动脉瘤出现了破裂、血栓、心肌炎之类的情况，那可是要人命的。甚至在康复期间，还会因为缺血性心脏病而突然死亡。如果能够及时发现非典型川崎病，可以在急性期给予阿司匹林或丙种球蛋白等药物，预后较好。
甲状腺滤泡上皮不典型增生，若甲状腺功能正常只需要进行观察，甲功异常时需要对症用药。
甲状腺滤泡增生是一种非毒性甲状腺肿，其原因主要是甲状腺分泌不足，TSH分泌增加，引起甲状腺滤泡增生肿大。在医生的指导下可以服用抗甲状腺激素减少甲状腺滤泡上皮细胞分泌的激素。尽量少吃含碘食物，减轻甲状腺功能亢进对患者生活的影响。其次，甲状腺滤泡增生应排除甲状腺炎、甲状腺乳头状瘤等可能性。细针穿刺，吸附细胞学检查明确病因，可进一步治疗。到医院行甲状腺功能检查，如有滤泡增生，一般需考虑手术治疗治病，常规药物疗效不太理想，需切除手术。
儿童不典型川崎病一般不会自愈。
儿童不典型川崎病一般在临床上可能没有明显症状，此时一般不易被发现，可能会导致病情延误，而病情延误可能会导致病情进一步加重，使患儿错过最佳治疗时机，可能会出现多种并发症。所以儿童不典型川崎病一般不会自愈，需要及时进行治疗，一般可以在医生的指导下及时确诊，进行积极治疗，有效控制病情，避免引起冠状动脉的病变，降低并发症的发病率。
非典型鳞状细胞，鳞状细胞是一个细胞的一个形态学的一个表述，因为鳞状细胞，还有线状、柱状细胞，这都是正常细胞表达，如果是非典型增生，增生到一定程度，它可能就是有一些变异了，那原位癌有一部分是这样子的。
不典型增生和非典型增生是一个意思，结果只是有不典型增生，说明还没有出现癌变，现在已经做手术了，以后应该就不会发生癌变了，还应该定期到医院去复查，半年或者是一年就复查一次。
