甲状腺功能低下是由于甲状腺激素分泌不足导致的。需要终生使用替代药物替代治疗。平时注意饮食以多维生素、高蛋白、高热量为主。不宜过食生冷食物。定期的复查甲功，注意预防感染，按时使用药物。
新生儿甲状腺功能低下，也就是甲减，是完全可治的一种疾病，主要是甲状腺素的替代治疗。通常使用药物来进行治疗，口服到两到三年以后，可以考虑可以试停药，有部分患者是可以停药的，停药以后就不需要再服了。但是也有一部分患者需要终身的服药，但是都是可控的疾病，另外在治疗过程中，要注意关注患者的体格以及智力的发育情况。
有76%的人会有抑郁的表现，比如无助，往往先于身体的表现。
有些病人还会出现幻觉，幻想等心理疾病。在做完手术之后，还可能会导致患有抑郁症，如甲状腺炎、长期服用锂盐等。与此形成对照的是，约10%的忧郁症病人存在某种程度的低甲状腺激素，并且经常出现亚临床症状。无征兆的自体免疫性甲状腺炎，在接受锂盐疗法的病人和分娩病人中，都会出现轻度的甲减，这些都会使病人出现忧郁症。
先天性甲状腺功能低下症状通常是进食少、喂养困难、便秘等。
先天性甲状腺功能低是由先天性因素造成的甲状腺功能异常，大概超过95%的婴儿在出生时并没有明显的征兆。但是，部分婴儿发病后会有动作比较迟钝、容易打瞌睡的表现，需要叫醒以喂养婴儿，婴儿还可能会发出沙哑的叫声。此外，婴儿多有食欲不佳、吃得少、喂食困难、便秘、体温较低等表现，可能出现体长偏短、皮肤干燥、舌头大、脐疝、囟门大、面部浮肿等症状。
甲状腺功能减退的治疗方法是甲状腺激素替代治疗，但在开始治疗前，必须确定这种甲状腺功能减退是否是永久性疾病。亚急性甲状腺炎后甲状腺功能减退一般为短暂减退，无需立即开始治疗。
另外，对于药物性甲状腺功能下降，停药后甲状腺功能逆转，无需立即进行药物替代治疗。对于永久性甲状腺功能减退患者，治疗目标是将血清促甲状腺激素水平维持在正常参考值范围内。治疗药物选择左旋甲状腺素片，治疗起始剂量因人而异。
新生儿出生后一般都需要在出生三天左右进行足跟血的采集，就是甲状腺功能低下的筛查。因为甲状腺功能低下有可能会对孩子的智力发育，体格的增长产生非常大的影响。
很多孩子进行检查，会发现有甲状腺功能低下症状，或者有促甲状腺激素水平升高或者偏低的情况。如果出现有数值的异常，考虑进行复查。很多孩子在进行复查以后都会有明显的改善，而且很多孩子是可以达到正常范围的。一般并不需要特别的治疗。如果复查之后仍然存在甲状腺功能异常，可以考虑应用相关的药物进行治疗。
