药物治疗，主要是使用抗生素药物，对于肾囊肿染病病因进行用药，控制症状；肾脏囊肿去顶减压手术，手术创伤小，另外，如果是不能耐受手术治疗的患者可以采用囊肿穿刺抽液治疗。
中药疗法：进行辨证施治，其治疗原则是急则治其标，多祛湿利水，缓则治其本，温补脾肾是其关键；病因治疗：主要是针对引起脑积水的原因进行处理，例如切除引起脑积水的肿瘤，清除引起脑积水的血肿，摘除引起脑积水的脑囊虫等方法。
面肌痉挛治疗的手段只有显微血管减压术，将压迫面神经根部的动脉用垫棉予以推移、分隔，这样搏动性压迫传导不到面神经上，面肌痉挛就予以治愈了。还有一些其他的临时性的办法，包括静脉性的药物，同时面肌痉挛的症状会有缓解。
低位无肛未合并瘘管者或者瘘管极细无法维持排便排气者，可行会阴肛门成形术。中间位无肛可行骶会阴肛门成形术。肛门闭锁又称低位肛门直肠闭锁，由于原始肛发育异常，未形成肛管，致使直肠与外界不通。
前列腺囊肿的治疗要是囊肿小的可以保守治疗，若比较大的囊肿已经有压迫症状等，要少食辛辣，饮水过少不但会引起脱水，也不利排尿对尿路的冲洗作用，所以要适量饮水，绝对要忌酒，过度劳累会耗伤中气，不可过劳，避免久坐，不可憋尿以及防止受寒等，另外要去专业的地方进行就诊。
