可以采用药物、手术等方法进行综合治疗。针对病因、梗阻严重程度及对侧肾功能等选择不同治疗方案。肾积水多因上尿路梗阻性疾病导致，如肾盂输尿管连接部狭窄、结石等。其也可由长期的下尿路梗阻性疾病导致，如前列腺增生、神经源性膀胱功能障碍等。
婴儿脑积水，因为不同病因的脑积水，结局可能是不一样的。通常的情况下单纯的脑积水治疗，都是可以治好的，通过脑积液的循环的引流，来达到治疗的目的。新生儿脑积水临床症状明显，表现为头围增大、前囟膨隆、头皮静脉怒张，甚至出现落日征，即双眼向下凝视、巩膜外翻。
如果胎儿脑积水较轻，小于1CM,部分可自然消退吸收。如不完全退行，则可在胎儿出生后经处理及分流手术根除。
如脑积水较重，在一般情况下，对于胎儿智力及发育都有一定影响，因此，提示应及早预防及确诊胎儿。建议孕妈妈多吃一些含蛋白质食物，补充蛋白粉、以及各种营养成分如复合微量元素，提前防止宝宝脑积水。主张孕妇要做好自我防护工作，经常进行胎儿排畸筛查工作，预防弓形虫病毒感染，避免婴儿脑积水。
胎儿脑积水的治疗方法，主要是根据胎儿积水量进行判断。
侧脑室的宽度在10mm以下，一般不需要进行手术，只要定时检查即可，否则会自动消失。侧脑室的宽度大于10mm，但不大于15mm，要进行DNA检测，也可以进行羊膜穿刺。
如果有大量的积水者，比如出现了侧脑室扩大的情况，就需要进行侧脑室的腹腔分流。如有颅内硬膜下积液，建议行硬膜下腹腔分流术。
盆腔积水通过以下方法治疗最好。
其实导致病理性盆腔积液的原因有很多，其中多数是因为细菌感染引起的一种病症表现，临床上可能会参照急性盆腔炎的治疗，给予抗生素以及其他药物治疗，但是必须要在专业医生的指导下用药，切不可大意随意服用抗生素，因为过量或者不当使用抗生素，引起的风险损害也是难以预料的。如果治疗一段时间，没有得到缓解，还需要及时到医院进行检查。
