瘘管的治疗方法有手术治疗、保守治疗和姑息治疗三种。手术治疗主要是做瘘管切除，如肛肠科的肛瘘，都采用手术治疗，可以做瘘管切除，也可以做瘘管挂线等手术方法。腹部的一些肠漏形成瘘管了，也需要手术修补。有些瘘管可以采取介入硬化的方式进行保守治疗，也可以收到很好的效果。少数瘘管为恶性病变，如果到晚期，就只能采取姑息治疗。
牙龈瘘管长期不治牙根周围的炎症无法消除，这样牙根周围的骨组织会慢慢被破坏掉，时间久了牙齿周围没有骨头的支持了，牙齿会松动脱落。严重的会影响到旁边的牙齿或者组织。
牙瘘管治疗效果比较好的，是根据牙齿的具体情况选择的一套治疗方案，是一种比较有效的治疗方法。有蛀牙或者是龋齿，都可以通过方案治疗的，要注意口腔卫生，睡前不要吃有酸性和甜性的食物，每天至少早晚各刷一次牙。
牙龈瘘管长久不治牙齿会提前掉落。牙龈瘘管一般是根尖周炎引起，不进行根管治疗及消炎等措施，可能会出现炎症感染扩散及临近颌骨出现吸收破坏的情况。而且会导致牙齿过早缺失脱落，多数根尖周炎通过根管治疗可保留牙齿，但不排除有牙髓坏死发炎或者牙根折断的可能。建议及时到口腔科去检查对症治疗。平时应该保护口腔卫生，早晚刷牙，定期洁牙，少吃含糖量高的食物。
牙齿瘘管不治疗会导致出现牙髓炎或根尖周炎，反复的慢性炎症刺激，会导致瘘管长期出脓，经久不愈。这种瘘管可能出现在牙龈黏膜，也可能出现在面部皮肤，皮肤瘘管影响美观及面部表情。
瘘管的治疗方法有传统拔线疗法和手术瘘管切除法没有其他治疗方法，肛裂药物治疗无效，肛瘘的特点是肛门外有一个或多个瘘口，长期分泌粘液，沿瘘口向肛门方向，可触及瘘口。
