胃间充质肿瘤与胃癌的主要区别在于其来源组织不同。间充质肿瘤来源于间皮组织，胃癌来源于上皮组织。此外，它的生物学发展并不相同。胃癌发展得更快，其结果也更致命。最后，在治疗上有很大的差别。建议尽快接受相关规范治疗，并与医疗队保持密切沟通。
间质瘤不是癌症。间质瘤是胃肠道间质瘤。胃肠道间质瘤并不等同于胃癌或肠癌。癌是指发生于上皮的恶性肿瘤，具有浸润性生长和容易复发和转移的特点。而胃肠道间质瘤则是发生于胃肠道的间叶组织，其局部侵袭性并不如癌症，较少的通过淋巴结，而是通过血液转移。
不是癌症，属于恶性肿瘤。确诊为胃间质瘤，一定要到正规的医院去进行手术切除肿瘤，如果不及时进行手术治疗是很有癌变的可能。如果手术治疗的效果不是特别好，可以进行放疗治疗。
癌症与肿瘤的区别在于肿瘤是指人体的某部分细胞，在某些因素的作用下，失去正常细胞基因的调节控制而异常增生，且在局部形成肿块的一种疾病，分良性和恶性两类，良性肿瘤细胞分化成熟、生长慢、不转移，恶性肿瘤(也就是癌)细胞分化不成熟、生长快，导致对邻近组织造成压挤、侵犯和毁坏，增生的癌细胞可随血液和淋巴带至身体其它部位进行增殖和破坏。
胃间质瘤不属于癌症，而属于肉瘤，并且具有潜在恶性。胃间质瘤的恶性程度，需要依据肿瘤的大小和病理组织进行判定。胃间质瘤的恶性程度可以决定其治疗方式，主要以手术和术后辅助治疗为主。