治疗灰指甲通常需选用抗真菌药物来进行。因指（趾）甲生长较慢，角质层比较厚，治疗时间会比较长，因此治疗时一定要保持耐心，足疗程规范用药。
若患者指（趾）甲出现不规则变形的表现，一般需在用药前将变形的指（趾）甲修挫掉，再外用抗真菌药物，如亮甲复方聚维酮碘搽剂。亮甲是治疗灰指甲的专用药，所含聚维酮碘、阿司匹林等成分可起到杀灭甲下真菌、抑制真菌再生、消炎止痒、加快药物渗透的作用，患者可按疗程并足量用药，能较显著地改善指甲变形、变色、翘起、糟碎、脱落等症状。不过需注意，如患者有多个指（趾）甲都已出现病变，则可在外用药物的同时，遵医嘱与口服抗真菌药物搭配治疗，如特比萘芬、伊曲康唑等。
由于灰指甲治疗周期较长，故用药方面需注意规范，不建议患者采用民间偏方或土方治疗，可能会加重病情或延长治疗时间，对患者的健康造成损害。
修脚店是不能治疗灰指甲的，拔甲二次感染的风险比较高，拔甲治疗灰指甲属于“治标不治本”的做法。拔甲只能清除掉指甲上面的真菌，甲床上的真菌并没有真正被杀死，一旦遇上合适的环境，真菌孢子苏醒，长出来的仍然是灰指甲。灰指甲属于一种真菌感染，具有传染性的，所以得了灰指甲，最后与家人隔开，不要同一种物品，去医院治疗，在家中服用药物就行。
灰指甲可以治疗。主要是各种真菌感染引起根据不同临床表现，针对性治疗。外用药物可以采用局部涂药或者封包削治。比如外涂或者泡病甲，连续3～6个月以上效果更佳，用药前可以将病甲削薄，再涂抹药物效果更佳。也可以采用抗真菌外用药物局部涂抹。也可以采用手术拔甲，主要用于单发的指甲。
治疗灰指甲的时长一般在三个月左右。
灰指甲一般被叫做甲真菌病，它是由一些真菌感染所引起的病变。一般采用内服和外用药物治疗，外用药包含阿莫罗芬搽剂等抗真菌的药物，内服药包含伊曲康挫，氟康挫等。治疗该疾病，若手指甲大概需要是三四个月左右，脚指甲的话，需要的时间会更长一点，大概四个半月，痊愈的速度一般由指甲生长的速度决定。
有可能是由于抵抗力差，或者是由于真菌感染引起的脚癣和灰指甲的。也有可能有传染性的。也是要尽快治疗会比较好，可以外用搽剂涂。如果肝肾功能正常，可以口服一些相关的药物。平时一定要多运动，多注意卫生，多增强营养。