男性生殖器在小便的时候疼痛一般是因为内部有炎症，因为生殖器内部有尿道，所以考虑是由于尿道炎导致的。尿道炎是一种性传播性的疾病，建议可以上医院查小便分泌物和小便常规明确诊断。
有可能是前列腺炎，前列腺炎会出现小便时有不适感，出现小腹部疼痛，如果确定是前列腺炎可以服用药物治疗，每天用温水坐浴，注意卫生，穿纯棉线的内衣每天更换，洗后暴晒，不要穿紧身的内衣和裤子，不要长时间坐着。
如果是出现腰痛并且出现绞痛，应该是腰椎间盘突出压迫到神经以后而引起的绞痛，需要检查出到底是哪个地方出现了疼痛，来确定腰椎间盘突出的部位，所以需要去医院进行治疗，一般需要牵引或者是封闭注射，以及做手术。
痛风的发作是非常疼痛的，痛风多是由于病人体内尿酸增高而导致，所以尿酸结晶会沉淀在关节腔内，从而会引起关节的肿胀和剧烈的疼痛感非常强烈，可以在发作期间一定要通过消炎镇痛的药物来暂时性缓解，并且饮食上要限制高嘌呤的食物摄入。
肺癌背痛是由于骨转移或者胸膜转移引起的，肺癌的背痛一般是疼痛比较剧烈的、患者难以忍受的，这种疼痛是持续性的。如果患者不确定引起背痛的原因，一定要及时去医院做相关检查确诊，可以做一个胸部的CT。
出现小便时疼痛的情况可能是因为前列腺炎导致的，但是也不排除有泌尿系统感染的可能，建议可以先到当地医院泌尿外科做个前列腺液的常规检查和尿常规看看，确诊后根据这些具体的检查结果来选择合适的药物进行治疗，在治疗期间，应注意多饮水、少憋尿，多运动、不要久坐，平时也要保持阴部的清洁卫生，这样可以尽快的缓解病情。
