对于亚临床甲减的治疗一般是应用甲状腺药物进行补充治疗。一般选用药物，从小剂量开始服用，注意定期复查甲状腺功能。另外，一部分食物中也含有碘，可以达到补充甲状腺素的效果，比如海带。临床甲减病人忌用生甲状腺肿的食物，比如避免食用卷心菜、白菜、油菜、木薯、核桃等，以免发生甲状腺肿大。
甲减主要对血管和心脏造成伤害。
甲减会导致动脉粥样硬化发病概率升高，致使冠心病发生几率增加，而，甲减的病程较长，尤以重度甲减最为突出，还可对肝脏产生影响，肾脏和其他许多重要的脏器，因此，甲减危害仍然较大。甲减对人们健康的威胁较大，它不仅可以引发各种并发症，还会出现贫血或者黄疸现象，甚至会引起高血压和糖尿病等多种病症，因此，必须要高度重视甲减。
甲减治疗，要注意患者的剂量要适当降低，有冠心病或其他心脏病病史及精神症状的患者甲状腺素更应该从小剂量入手，且要慢慢增加。
因血清中T3,T4浓度正常值范围大，甲减病人情况有轻有重，生活环境和劳动强度时常发生变化，对于甲状腺素的需要量和敏感性亦不尽一致，因此，在治疗上应注重个体化。
以预防腺垂体功能减退患者的发生，急性肾上腺皮质功能不全的出现，甲状腺素治疗应于皮质激素取代治疗之后进行。
甲减注意事项有很多，具体分析如下：
一、甲减是终生的疾病，需要长期服用优甲乐，由于甲减的甲状腺激素分泌很少，需要服用外源性的激素，因此甲状腺功能正常是吃优甲乐的缘故，停药后甲状腺激素会下降，甲减患者必须终生服用优甲乐，不能停药。
二、桥本氏甲状腺炎伴有甲状腺功能减退，有高的球蛋白和过氧化酶抗体，平时要避免食用含碘高的食物，比如海带、紫菜、无碘盐等。
三、甲减治疗的第一年，建议每月进行一次甲状腺功能检查，以便了解替代品的数量，如果不足的话，可以适当调整用量。一年后，替代剂量基本稳定，3-6个月复查一次。
患有甲减可以对症口服甲状腺片进行调理治疗疾病。在用药物调理治疗的同时应多吃富含碘的食物，适当的多吃一些海带海菜，紫菜等海产品，应合理营养饮食，应戒烟戒酒，忌食油腻性较大的食物和高胆固醇食物，注意休息。
