对于先天性心脏病，最好的治疗方法就是进行外科手术。比如主动脉瓣狭窄、肺动脉瓣狭窄、主动脉收缩等。如果能得到及时的外科治疗，那么治愈率就会很高。先天性心脏病经解剖学处理后，可使其恢复正常。如果患者有先天性心脏病，那么就可以恢复到正常人的生活方式和生活品质。对于先天性心脏病，尽早诊断和治疗是非常重要的手段。
心脏移植主要适用于周末性心脏病，以及无法用于目前手术方法的复杂性心病，还有就是其他治疗。其他治疗主要是介入治疗部分代替，还不能完全代替外科手术的开胸手术，并且也有严格的适应症，比如球囊扩张，解除血管引起瓣膜的狭窄，主动脉狭窄，肺动脉瓣儿狭窄，主脉缩窄等。
怀孕期间用彩色多普勒超声可以判断胎儿是否患有心脏病。如果相对温和，彩色多普勒超声也有可能存在不确定性。胎儿出生后，如复查后确诊为先天性心脏病，需要及时进行对症治疗。严重的先天性心脏病需要手术治疗，并能在温和的条件下自行逐渐恢复。
先天性心脏病可以通过使用药物、进行手术等方式进行治疗。
1.使用药物：对于先天性心脏病，患者可以在医生的指导下使用呋塞米、地高辛等药物进行治疗。治疗期间，患者应当多休息，不要进行过于剧烈的运动。
2.进行手术：先天性心脏病患者在必要时，还可以在医生的指导下通过室间隔缺损封堵术、先天性心脏病纠治术等手术的方式进行治疗。
孩子有先天性心脏病，一般都是采取手术治疗。这孩子的生活没有什么影响。心情非常容易影响病情的变化，患病后一定要积极的调整自己的心态，配合医生的治疗。同时自己要多休息，保持情绪的稳定，避免劳累，保证充足的睡眠，如果发现身体有什么不舒服的症状，要及时到医院检查治疗。
大多数需要终生服药，有少数在医生指导用药下能很好控制不发作5-6年，可以慢慢减量药物直至停药，在这个过程中如果没有癫痫发作，可视为痊愈，合理选择药物，一旦药物能平稳控制癫痫发作，不能随意增减及停用药物，容易引起耐药性癫痫及癫痫持续状态的发生。另外不受凉、劳累、感冒及情绪不稳等诱发因素。加强体质锻炼，起居有规律，忌烟、酒、茶、咖啡等刺激性食物。克服自卑感及恐惧心理，疲劳、紧张等因素刺激。
