可能是感染导致，感染可发生在生殖器的任何部位如包皮、龟头或者尿道等部位，感染以后会造成局部黏膜的肿胀或者造成水肿等，故而会出现明显的胀痛感，尤其是急性感染甚至可以造成黏膜糜烂、渗出或者分泌物增多，伴有局部的刺痛感。
男性生殖器尿痛指病人排尿时尿道或伴耻骨上区、会阴部位疼痛。其疼痛程度有轻有重，常为烧灼感，重者痛如刀割。尿痛常见于尿道炎、前列腺炎、前列腺增生、精囊炎、膀胱炎、尿路结石、膀胱结核、肾盂肾炎等。治疗尿痛首先要控制急性感染，同时配合药物外洗。
有可能是前列腺炎，前列腺炎会出现小便时有不适感，出现小腹部疼痛，如果确定是前列腺炎可以服用药物治疗，每天用温水坐浴，注意卫生，穿纯棉线的内衣每天更换，洗后暴晒，不要穿紧身的内衣和裤子，不要长时间坐着。
男性生殖器流浓且尿痛常见于链球菌性尿道炎。链球菌性尿道炎是很常见的性传播疾病，通过不洁的性接触来传播，致病菌是链球菌。链球菌属于革兰阴性的双球菌，感染人体尿道黏膜引起局部炎症反应，通常起病较急，尿道有脓性分泌物产生。
肛门疼痛的病因是很多的，还是及时到当地正规医院肛肠科做个肛门指检，肛镜等相关检查，明确后在医生的指导下进行有效的治疗。平时饮食上不能吃辣椒花椒，牛羊肉等刺激性的食物，同时不能抽烟喝酒。
