龟头炎使用抗炎和抗菌性药物来治疗。
如果是细菌性龟头炎可以现在复方苦参洗液外洗，局部可以涂抹抗炎药物来配合治疗。如果是真菌感染，可以用5%的碳酸氢钠外洗，局部选用抗菌药物来治疗。
建议患者在日常生活中注重个人的饮食，戒烟戒酒，不要食用生冷、辛辣等食物，多吃新鲜蔬菜，多饮水，注重私处卫生的护理工作，保证皮肤清洁卫生，穿全棉内裤，治疗期间禁止性生活，避免发生细菌感染。
龟头炎可进行局部用药治疗和全身治疗。一般日常处理要保持局部清洁，避免各种刺激。避免不洁性交，治疗期间暂定性生活，如为滴虫或念珠菌性龟头炎，应夫妻同时治疗。急性期避免使用皮质激素类药物，以免加重感染。包皮水肿严重者，切勿强行上翻包皮。包皮内板和龟头有溃疡或糜烂时要及时换药，每日换药2次。少吃辛辣刺激性食物，忌烟酒。
如果感染生殖器疱疹的话，就要使用抗生素。注意保持心情愉快，需要注意的是此病是有可能复发的，在中药方面可以使用一些健脾利湿、滋阴清热的中药，严重者的需要静脉注射干扰素，有些消炎药物也可以抑制病毒发作，减轻症状。
经常清洗包皮和阴茎头，保持包皮腔内清洁和干燥。如有包皮过长或包茎时应行包皮环切术。平时应清淡饮食，避免吃辛辣刺激性食物，平时要注意局部卫生保持清洁干燥，穿宽松纯棉内裤，水肿明显则需暂时禁止性生活。
龟头肉粒多与珍珠疹有关，是正常的生理变异，不需要特别的治疗，但是也不能拖延太久，不然会出现问题。如果有不洁的性生活，要排除尖锐湿疣的可能性，如果只是珍珠疹不需要治疗，这种病影响到正常的性能力，需要考虑激光去除。
龟头糜烂是包皮龟头炎的症状之一。龟头糜烂科学的用药，一周即可恢复正常，典型的包皮龟头炎症状，糜烂渗液为主者，用医药药水湿敷。如有溃疡面，需要局部包扎，每日换药。忌用各种油剂或粉剂，以免局部刺激使症状加重。
