针灸是根据人体不同部位的组织厚度来扎深浅找到穴位的。大约针头长度的三分之一，一般根据有麻酸肿胀感就行，有些部位不能直扎，只能斜扎，如肚皮膀肛，胸部也不能扎深，扎穿胸膜会得气胸的。不同穴位的进针深度不同，四肢一般进针深，头部身体浅。但也不绝对，比如胖人相应进针深，还有透穴等。还有平刺或斜刺等手法。
一般选用的穴位包括天柱、风池、夹脊穴、大椎、肩井这些穴位，再一个，是针对头晕这种症状，治标的一个治疗，一般选用的穴位有百会、四神聪、神庭、太阳、印堂等，这两组穴位一个治本。
针灸治疗失眠常用穴位如神门、内关、督脉上的百会穴、特定穴、安眠穴、荥俞、肝俞、脾俞穴位。针灸治疗失眠疗法中，除了常规针刺外，皮肤针法、耳针法等也常用于失眠的针灸治疗。
偏瘫针灸穴位有头面部：百会、上星、印堂、迎香、太阳、下关、地仓、人中、翳风、风池等；上肢：曲池、手三里、外关、内关、合谷、少泽、后溪等；下肢：环跳、秩边、风市、阳陵泉、足三里、承山、三阴交、昆仑、涌泉等。
通常情况下，痛经可以针灸三阴交、中极、足三里等穴位。具体情况分析如下：
痛经有实证，有虚证，腹痛多在经前或经期出现，疼痛剧烈，拒按，经色紫红或紫黑，有血块，血块下后疼痛缓解，为实证。针灸时可选取三阴交，中极，次髎；如果患者经前伴有乳房胀痛，舌质暗有瘀斑的属于气滞血瘀型，可在上述穴位基础上加太冲；腹痛有冷感，得温热疼痛缓解的患者为寒湿凝滞型，可加归来，地机。腹痛多在经后，小腹绵绵作痛，少腹柔软喜按，经色淡，量少，为虚证，治疗以调补气血，温养冲任为主，可取三阴交，足三里，血海；若患者伴有面色苍白，倦怠无力，头晕眼花，为气血不足型，可加脾俞，胃俞；伴有腰酸膝软，夜寐不宁，头晕耳鸣，舌红，少苔者，为肝肾不足型，可加太溪，肝俞，肾俞。
