直肠癌的化疗通常以氟尿嘧啶为基础，如FOLFOX方案，即奥沙利铂加氟尿嘧啶，或者XELOX方案，即奥沙利铂加希罗达。如果病情比较晚也可以采用基因检测，进行靶向治疗或者生物免疫治疗部分患者也会获得良好的预后。
直肠癌术后化疗时间间隔不宜过短，因为病人手术治疗之后身体比较虚弱，需要调养一段时间等身体恢复差不多时才能进行化疗，一般在术后3~4周身体就已经恢复差不多，就可以开始化疗治疗，需要坚持化疗6个疗程，一个疗程在21天左右，需要坚持化疗半年左右时间。
是4-6次，以4-6次为多，这样可以将病灶明显的缩小，使患者重新获得手术切除的机会。目前临床上的例子来讲，多数的晚期的肿瘤来的时候不能切除，通过新辅助化疗进行4-6次甚至6-8次，可以成功的将它转化为可以切除的肿瘤。
一般化疗两周期复查ct等相关检查，评价化疗效果；若有效，继续化疗两个周期，若无效，需要化疗更改化疗药物继续化疗两周期后再评价。一般化疗4-6周期。建议清淡营养饮食，戒烟，戒酒，忌辛辣、刺激性食品，少量，多餐，少食腌制烟熏食品，日常应多食牛奶、鱼类、肉类、家禽类、豆制品等蛋白质含量高的食物，多食含维生素丰富的水果，即新鲜蔬菜，多食谷物，少食高脂肪食物。
直肠癌化疗一个疗程大约6天。化疗药物的毒副作用有：脱发，恶心，呕吐，白细胞下降等，但是化疗就是要杀死癌细胞，杀癌细胞的同时肯定也会杀死一些正常细胞，没办法的。饮食上可多吃些含硒的食物，硒在医学上具有防癌抗癌的作用。