脑囊肿可分为蛛网膜囊肿和室管膜囊肿，前者占绝大多数，后者少见。蛛网膜囊肿是脑脊液样的囊液被包围在蛛网膜所形成的袋状结构而成，最常见于中颅底、桥小脑角、鞍上和颅后窝等。可致颅内高压，引起脑水肿、脑疝，危及生命。
囊肿不会癌变，但有些癌在病变过程中会长成囊肿。囊肿的囊壁是一层膜状结构，其内皮有分泌功能，能分泌浆液，如腱鞘囊肿、肾囊肿等，这些囊肿是良性病变，不会癌变。而在一些癌性病变，当肿块中间发生缺血坏死，坏死组织液化并被包裹，形成囊性结构，或一些恶性病变中具有一定的分泌功能的癌细胞逐步增长，形成囊性结节，就是癌性囊肿，如粘液囊腺癌。
肝囊肿通常很少引起疼痛。疼痛不适仅在伴随细菌感染和炎症刺激时出现。它主要引起压迫性疼痛，如体积增大和血液循环不良，导致胸闷和胸痛。肝囊肿可以通过疏通或外科穿刺引流来治疗。
卵巢囊肿的主要症状表现为月经失调，小腹疼痛，腹胀，腰酸，白带增多，不孕症等，囊肿大多是良性的。囊肿比较小的，对机体的各方面影响不大，不会影响生育。平时要做到随访观察，定期复查。
肉芽性囊肿要进行全身抗菌抗炎的治疗。也可以采用手术的治疗方式，把囊肿切除。如果效果不好，还通用泡水坐浴治疗。效果不错。在饮食上也需要注意，不要吃辛辣的食物，不要吃油腻的食物。
