如果肛瘘患者不行手术治疗，瘘管内反复会出现急性感染，严重的会再次形成肛周脓肿，然后脓腔有可能会向周围组织再次出现破溃，从而将单纯性肛瘘变成复杂性肛瘘，增加手术治疗难度。还有由于肛瘘外口时常会有反复流脓肿痛，局部炎症的刺激有可能会导致局部的变性，甚至产生恶性肿瘤的可能。
如果不手术，手足癣的并发症也是有很多的，手癣严重能够引起疼痛感和不适感，而且的甲内肌肉也会暴露在外或是被增厚的指甲所压制，一旦受到外伤的侵害，细菌就会长驱而入，引发甲沟炎、甲床炎、手指脓皮病等并发症，使得出现丹毒或是蜂窝组织炎等全身症状严重的疾病。
精子畸形会导致男性不育或者是生育质量差，影响夫妻感情，危害家庭的幸福，也会影响生育质量、即使勉强受孕。也会给胎儿带来不良影响，要积极的治疗原发病，去除引起精子畸形的原因。
癫病不手术症状会越来越重，会威胁生命的，癫痫通常是大脑神经元异常放电引起的问题的，症状有抽搐，口吐白沫，意思丧失，眼角上翻，大小便失禁等，造成这个问题的因素比较多，通常分类分为原发性和继发性的。
包皮包茎不手术也可以，需要经常清洗。包皮过长容易残留包皮垢，包皮垢长期刺激阴茎头，特别是冠状沟部，易引起包皮炎和龟头炎。另外包皮长期刺激龟头可以使龟头敏感性增加而导致早泄。性生活时也容易发生包皮坎顿。从预防感染及提高性生活质量的角度考虑还是尽早做包皮手术。
继发性癫痫不手术的后果是会对病人生活的质量产生比较大的影响。癫痫病不手术治疗会出现重复发作，长此以往可能引起记忆障碍、智力下降、性格改变，又可促使发作次数增多。一些继发性癫痫常伴有智力低下，甚至不乏有智残者，重者可危及生命，需要及早对症治疗。
