分泌物有腥臭味、肚子疼可能是多种原因导致的，具体分析如下：
一般是妇科炎症性疾病，如阴道炎性疾病、宫颈炎性疾病、子宫内膜炎性疾病等。患者可以通过妇科内检来初步确定患者阴道、宫颈是否有充血水肿，子宫体或双侧附件区有无压痛、增厚等症状，还需要对分泌物进行化验，确定是否有炎症。另外，如果有腹痛和分泌物臭，也不能排除是卵巢癌症、子宫内膜癌症、宫颈癌等肿瘤性疾病，需要结合具体情况进行检查。
排卵期第十一天肚子疼有褐色分泌物可以是附件由炎症引起的痉挛。需要及时的去医院进行治疗，然后生活中的话要注意饮食要清淡，不要食用那些辛辣的食物，禁食寒性如海鲜冷食，还有要注意自己的休息时间，多喝一点热水，还要多注意一下卫生环境。
肚子疼有褐色分泌物可能是在排卵期，女性体内的雌激素含量会暂时降低，导致子宫内膜失去荷尔蒙的支撑，导致局部的子宫内膜剥落，这就是所谓的“排卵期”。还有就是盆腔炎、宫颈炎等妇科疾病，如果想要避免出现宫外孕和预兆流产，可以去医院查尿怀孕测试和抽血查人绒毛膜促性腺激素。在治疗过程中要保持良好的个人清洁和不能有性行为。
建议肚子疼有褐色分泌物的患者根据实际情况前往医院就诊检查。
如果例假前的分泌物是水，例假后就恢复正常，考虑可能是激素的影响，可以不用治疗。如果例假后还是没有改变，就要去医院妇科检查一下白带常规，再针对病因，进行治疗。
要去医院查妇科彩超，看一下胚胎的发育情况，并排除一下宫外孕，因为在孕早期出现了肚子疼和阴道流血，首先有可能是先兆流产引起的，但也有可能是因为宫外孕，做彩超，如果彩超证实是正常的宫内怀孕而不是宫外孕，如果打算要宝宝的话，就要给予药物保胎治疗。
怀孕早期肚子疼有褐色分泌物需要到正规的医院做相应的检查，在医生的指导下对症处理，避免造成严重的危害。这期间注意多喝温开水，多吃容易消化吸收的食物，不可以吃辛辣刺激性的食物。
