对于肾盂囊肿，包括肝肾囊肿，如没有症状或长的速度很慢，一般不要治疗。对于生长很快的囊肿或有压迫临组织的囊肿还是主张手术治疗。药物对囊肿的吸收基本无效。半年到一年复查一次B超，如有不适及时复查。吃药可能效果不好，还增加心理负担和经济负担。
问题不大的，也就是说可以不用做手术处理，那么如果是周边的一些组织都会受到影响，那么就不能够停止任职，可以采取更有效的方式进行切除，可能效果相对来说会更好一点，但是也需要看身体情况。
目前手术治疗首选腹腔镜下肾盂旁囊肿去顶减压手术。因为囊肿和肾盂的关系密切，手术有一定的难度，术后出现漏尿的几率也比一般肾囊肿的手术要高一些。术后要密切观察引流量，如果出现漏尿，引流管要长期置放，以致形成瘘道后再拔除。
右肾下端肾盂旁出现囊肿，这个手术切除比较合适，现在一般选择激光手术，这个囊肿有恶性的可能，所以尽早手术治疗。如果不手术切除，建议定期复查，1到3个月之间复查一次，如果增长的明显，及时手术，有时这种囊肿生长的速度比较快，有压迫肾脏的，导致肾功能受损的。
辨证施治,针对病因给予清热解毒,熄风止痉,健脾滋肾,补肾生髓等中草药.特别是在缓解期选择此类中药,可以预防复发,达到事半功倍的作用.针灸治疗,以整体治疗为原则,采用普通毫针,头针,水针及背部俞穴针刺等多种疗法,根据症状所需施治,用于急性期和缓解期。
除正常的激素治疗外可逐步的用中医替代且对人体无毒副作用，应增强机体免疫功能，提高肌体抗病能力。营养神经，中西医结合扩张微循环使受损残余神经得到充分的血供，预防病情继续发展。中西医方法的有效治疗目前得到良好的反应。通过修复受损的神经元和神经纤维，采用物理仪器的配合将药物快速送达病灶部位，加快病情恢复。
