两者存在实质上的区别。乳腺增生主要是乳腺结构紊乱，乳腺囊肿说明体内肿块呈囊样增生。乳腺囊肿一般会手术切除，而乳腺增生可以保守药物治疗，物理治疗都是可以控制病情的进一步发展。
乳腺增生是乳房乳腺小叶有增生变化的一类疾病，而乳腺囊肿是属于乳房有感染的情况存在的症状，导致局部有囊肿的变化，治疗办法也是不一样的，乳腺增生主要是用活血化瘀的中药，而乳腺囊肿需要做积极的抗炎治疗，乳腺增生主要发生于育龄期的女性，表现为月经来潮之前，乳房不同程度的胀痛，月经来潮之后，会有所减轻或者是消失。由于乳腺疾病与情绪有一定的关系，所以注意情绪的调节，避免愤怒等不良情绪影响。
乳腺囊肿口服一些中成药物治疗效果比较好，乳腺囊肿一般是由于乳腺的小叶增生引起的，平时还要注意在饮食方面多吃木耳，蘑菇等对乳房有益的食物，还要注意保持良好的心情，避免生气。
乳房良性疾病包括乳房增生和乳房囊肿，其发病原因和临床表现都不相同。
1、病因：乳房增生是一种女性荷尔蒙分泌水平不正常所致，这是一种以乳房疼痛为特征的乳腺疾病，通常是因为乳房组织的增殖或乳管膨胀，使乳房腺管积液存在；
2、临床表现：乳腺增生主要表现为在月经来潮之前的胸部胀痛、不适，月经来潮后的乳腺胀痛、不适症状会随荷尔蒙的分泌降低而减轻。乳房囊肿一般不会有太多的表现，当乳房囊肿大的时候，会有胀痛的感觉。
乳腺囊肿，里面是液体，质地韧，有弹性，圆形或椭圆形，乳腺增生是正常的生理过程，周期性乳房疼痛，乳房肿块，少数人有乳头溢液，乳腺增生是良性病变，和体内激素是有关，有周期性的乳房疼痛，乳房有包块儿，没有疼痛的现象。
乳腺囊肿其实也是乳腺增生的一种。不过乳腺囊肿，里面是液体。而乳腺增生是个正常的生理过程。如果身体允许，要进行手术治疗，快速有效切除病灶，遏制病情的进一步发展，有利于身体健康，及时将检查结果交给接诊医生，有利于医生分析病情，然后配合医生进行治疗，有利于病情的好转。
