直肠炎反复患者可以口服氧氟沙星、甲硝唑、奥硝唑等药物治疗。
直肠炎患者除了要积极配合医生治疗以外，平时要养成良好的饮食习惯，注意饮食卫生，戒烟戒酒，避免浓茶浓咖啡，不能吃辛辣刺激性食物，注意腹部保暖。治疗期间患者要注意多休息，同时坚持清淡饮食，不要吃辛辣刺激性食物，比如火锅、冰可乐等，有利于身体恢复。
直肠炎的病人的治疗，主要包括两方面：一个是修复病人的肠道黏膜；第二个是缓解临床症状。胃肠炎的病人在行肠镜的检查过程中，一般可以发现病人的直肠黏膜有充血和糜烂。在治疗上，需要使用一些药物，比如合适药物肠溶胶囊，来修复病人的肠道黏膜。如果病人腹泻的症状比较严重，或者在腹泻的过程中，还有解血便的情况，可以用控制病人直肠炎症的药物，比如有合适药物剂等，都是可以用的。使用的时间，根据病人症状的缓解程度而定。
直肠炎的治疗主要是三个方面，第一调整饮食生活，少渣饮食为主，荤素搭配。第二药物治疗。第三中医中药治疗目前较为常用的穴位埋线治疗。直肠炎病人一定要坚持治疗避免其迁延不愈引发结肠炎或是直肠溃疡等疾病影响生活质量。
可根据病情口服药物或者打滴液进行治疗。还可以进行灌肠，将温橄榄油注入直肠内。直肠黏膜萎缩变干者，可每晚于直肠内注入指定药物。也可用蜂蜜、芝麻油，隔一日交替保留灌肠，每日2次，有很好的疗效。
细菌性的肠炎，需要使用抗生素控制感染的。但是病毒性的肠炎，对症处理就可以了。适当的多喝水以免出现脱水的情况。可以选择口服补液盐的，不管是什么原因引起的拉肚子都需要注意饮食卫生，尽可能吃一些容易消化的食物，并且采用少量多次的喂养方式。
宜多食各种新鲜水果、蔬菜，进低脂肪、低胆固醇食品如：香菇、木耳、芹菜、豆芽、海带、藕、鱼肉、兔肉、鸡肉、鲜豆类等。找个好的治疗方法一次性治疗，EGF阶梯免疫重组疗法就是专为治疗直肠炎准备的疗法。平时要注意休息，多喝热水。
