卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
一般情况下，卵巢囊肿是可能会复发的。
卵巢囊肿的手术分为囊肿剔除术和卵巢切除术，如果患者在手术时选择的是囊肿剔除术，手术后体内有残留的囊壁，手术未切除干净，且手术后不注意护理，就可能会复发。有的患者除了患有卵巢囊肿，还合并有肾囊肿、肝囊肿，也可能会复发，且复发率可能会比较高。建议患有卵巢囊肿的患者应及时在医生指导下进行治疗，以免影响身体健康。
由于卵巢囊肿手术后容易出现反复发作，因此预防和治疗非常重要。
1.日常要有规律的作息时间，保持好的生活方式，避免出现一些基础疾病。
2.要有良好的心理状态，避免出现激素失调。
3.做好避孕，以免进行人工流产手术。
4.日常生活中要多做运动，同时要保持月经期间的清洁卫生。
5.要有规律的检查，以便及时掌握身体情况。
卵巢囊肿是可以通过手术取出囊肿的。平时要多注意情绪的调节，保持心情舒畅，多休息，多吃些清淡的，少吃辛辣刺，激性过大的食物，多吃水果，多喝点热水。具体需要遵训医嘱。
患者想要有效预防卵巢囊肿的复发，要注意改变生活方式，不可以经常吃刺激性的食物，比如葱、辣椒等，这些食物可能会导致身体激素分泌水平紊乱，从而导致卵巢囊肿。
患者注意尽量避免使用激素类的药物，可能会导致卵巢囊肿，要尽量采取科学性的生活方式，平时注意心情，保持良好的心态，还要注意从压力方面进行调理，还要养成良好的生活习惯。
