首先，粪便中有很多细菌，肛周很容易受到感染，引发肛周汗腺、皮脂腺感染，而生疮疖、脓肿，温水坐浴能保持肛周的清洁。其次，坐浴20~30分钟，水温恒定在40℃左右，不仅能够促进血液循环，还能避免肛周炎症的侵袭。手术后，热水坐浴可达到缓解疼痛，加速伤口愈合功效。最后，孕妇活动量少，肠胃功能弱，大便干燥而引起痔疮。每次大便后用温水熏洗肛门，改善肛门局部血液循环，预防痔疮。
一般情况下，温水坐浴可以治疗前列腺炎。具体分析如下：
用温水坐浴可以改善前列腺的充血、肿胀等症状，从而缓解前列腺炎，明显的降低会阴部坠胀感，减少尿频的次数。患有前列腺炎，建议患者经常进行温水坐浴。也可以在医生指导下使用左氧氟沙星片、盐酸环丙沙星片、阿莫西林片、盐酸米诺环素胶囊等药物进行治疗。平时还应该注意清淡饮食。
温盐水坐浴效果更好，遵医嘱在肛门内置药丸，大便干燥时加服通便药物，多吃水果和蔬菜，以防便秘，避免蹲厕过久，每日做提肛动作。近期不要吃酸辣及刺激性食物、多喝水及少吃油炸类食物。
肛裂使用温水坐浴有可能获得自愈，在裂伤比较表浅时，通过温水坐浴，同时养成良好的排便习惯和生活习惯，保持大便松软，浅表的裂伤可以治愈，而无需手术治疗，所以说在浅表的肛裂时使用温水坐浴，有可能自愈。
尽量的不要用温水热水泡阴囊睾丸。因为正常情况，睾丸的温度要比体温低1到2度。温度有利于精子的生成以及成长，如果患者用温度过高的水洗，就会导致死精。用温水泡阴囊，相当于增加睾丸的局部温度，对精子的生成是不利的。所以未生育的男性，不建议长期用温水坐浴。
温水治疗对前列腺增生确实有治疗作用，但是不能夸大温水坐浴对前列腺增生的治疗，温水坐浴可以有效的减轻前列腺充血和水肿，对于改善膀胱逼尿肌的收缩力是有效地，可以有效放松尿道括约肌，有效的促进大便变的更加通畅，所以温水坐浴对前列增生有治疗作用。
