有的，会影响其发育，导致生育功能失调。隐匿性阴茎其原因是多方面的，阴茎皮肤发育不良，过短；包皮腔过小；阴茎皮肤没有包着阴茎海绵体，导致阴茎海绵体无支撑而回缩体内。
隐匿性阴茎手术比一般手术恢复慢，一般手术伤口一周基本愈合，但是隐匿性阴茎在阴茎上做手术，阴茎比较特殊，比较敏感，慢的需要一个月。做完手术以后在医院里，术后一周回家，因为伤口还没完全愈合，建议在家里继续休养一周，以休息为主，避免剧烈运动、游泳等。
隐匿性阴茎是一种发育先天所造成的问题，如果不通过手术的方法是很难自动长好的，但是由于宝宝目前还小，所以可以暂时密切观察，也有可能是由于腹部脂肪过多过厚而造成的假象。是否为隐匿性阴茎，需要经过检查才可以得知，可以到当地正规公立医院泌尿外科或儿科检查。
隐匿性阴茎可以考虑去掉耻骨联合上方阴茎旁边的脂肪，使变薄让阴茎露出来，手术属于中等程度的手术，术后可能需要三个月左右的时间恢复。做完手术之后要注意勤换药，保持敷料干燥卫生。
隐匿性阴茎指的是发育正常的阴茎，由于各种原因导致阴茎头不能外露。
当它处于疲软状态时，大部分阴茎海绵体都隐藏在阴腹区和下腹区的脂肪中，很少能在体表看到，包皮是一种空虚的状态，常伴有包茎和包皮外口狭窄。阴茎勃起时，阴茎的长度和直径与正常成人接近，根据病因可分为隐匿阴茎、埋藏阴茎和限制阴茎。患者通常可以通过手术方式，缓解临床症状。
