月经是有固定周期的，会基本在每个月都某个时段出现阴道出血，可能伴有腹痛，腰骶部坠胀感等不适。一般出血比较多，持续时间比较长。而自然流产主要表现为停经后阴道流血和腹痛，颜色为鲜红色、粉红色或深褐色，一般出血比较少。
当阴道出血与正常月经时间、量等不同，或伴有与平时不同的腹痛等症状都应提高警惕和排除怀孕的可能。特别是阴道出血比上一次正常月经时间推迟，量与正常月经不同，应怀疑流产的可能。自然流产的主要症状是出血和腹痛，如不能及时就诊，发生不完全流产导致出血时间过长、有组织残留于宫腔内，都有可能引起宫腔内感染。
问题分析：根据您的描述情况，考虑自然流产以后，内分泌激素水平不稳定，而影响了正常的月经周期。
指导建议：建议需要去医院进行相关检查一下，例如妇科常规，盆腔B超等等，如果没有异常情况可以采取一些药物进行调经治疗，而且流产以后也要进行常规性的调经治疗，促进恢复。
流产后三个月不来月经，考虑是存在闭经导致的，跟内分泌没有完全恢复好有关系，目前可以服药物催经。平时不要熬夜，养成良好的生活习惯，肥胖的话适当减肥，过度肥胖是影响卵巢功能的，如果打算再次备孕的话，在半年以后再备孕。
自然流产颜色一般有鲜红色、粉红色或深褐色的，有时伴有轻微下腹痛，出血的量不一样，月经的出血量要明显多于流产的出血量。再者，月经出血持续时间大概只有3-7天，流产流血的时间必须在孕囊清除后出血才能够停止。
宫外孕自然流产后半个月左右就会恢复排卵，通常一个月左右再次月经来潮，如果两个月了月经仍然没有来潮，注意检查一下，是否有再次怀孕的可能，另外，检查下妇科超声和女性激素六项。