常见原因是泌尿系统疾病，大部分原因主要是由于泌尿系统疾病引起的，如肾小球疾病、间质性肾炎、尿路感染、泌尿系结石、泌尿系肿瘤、多囊肾等。还有全身性疾病，如感染性疾病、血液性疾病、自身免疫性疾病、心血管疾病。由尿路邻近器官的疾病造成的，如前列腺炎盆腔炎、宫颈炎、结直肠炎。
血尿是由尿路邻近器官的疾病造成的。如前列腺炎盆腔炎、宫颈炎、结直肠炎。还有化学物品或者药品损害，比如磺胺类、避孕药、重金属、环磷酰胺、抗凝剂等造成的。另外，还有一种是功能性的血尿。
产生血尿的原因很多但主要由泌尿系统疾病引起如肾结核、肾炎、尿路感染、尿路结石血尿同时伴有较长期的尿频、尿急、尿痛者以肾结核的可能性较大，如血尿伴眼睑、面部或全身浮肿血压增高及发热等症状可能是急性肾炎，如血尿伴剧烈的尿频、尿急、尿痛者大多为急性膀胱炎。
肾积水引起的原因是输尿管结石，感染，肿瘤等疾病导致，有血尿一般考虑结石引起，部分肿瘤也可以出现无痛性肉眼血尿。肾积水分为轻度肾积水、中度肾积水、重度肾积水。轻度肾积水是指肾脏集合系统分离1cm左右的，没有明显的发热、腰疼等症状可以定期观察。
肾积水有先天性的因素，也有后天性的原因。先天性的原因包括输尿管节段性的肌肉缺如或者发育不全，输尿管狭窄，输尿管瓣膜橛结构，马蹄形肾，先天性输尿管囊肿，双输尿管等，后天性的原因包括肾结石，泌尿系统炎症瘢痕，肾盂或输尿管息肉、肿瘤、外伤等。
怀孕肾积水可能是多种原因导致的，具体分析如下：
妊娠时子宫增大对输尿管造成或原有的肾结石是引起肾积水的主要因素。妊娠晚期还属于轻度肾积水，一般在生产结束后就会自行消失，只要定期进行观察即可。严重的肾积水，首先要看肾功能，看有没有引起孕妇的痛苦，正常的话可以在产后进行治疗，必要时可以做肾积水引流，但有一定风险。
