肝内毛细胆管炎治疗包括抗炎、保肝、解除胆道梗阻，利胆以及其他支持等治疗，主要有内科保守治疗和外科手术治疗。内科保守治疗当中，病人如果能够改善症状，促进病情缓解，可以避免手术。
腹痛：疼痛程度由隐隐钝痛到剧烈绞痛不等，不间断性或阵发性。疼痛多在剑突下有点右，肝内胆管之炎症可痛在肝区或左上腹，常向后背或右肩放射。炎症发展到胆管浆膜及其周围时可有腹肌紧张及反跳痛。恶寒发热低热或高热，微恶寒或寒战。可伴心率、脉搏加快。
急性胆管炎往往比较严重，需要注意临床症状和化验检查的情况，如果高热或者黄疸以及出现休克等还是有生命危险的。如果只有腹痛和恶心呕吐没有发热高热和寒战以及黄疸就病情不严重。急性胆管炎的病症，多数是属于细菌感染引起的，多与胆结石的病症同时出现。这样的病症得需要通过中西医结合的办法进行治疗。
右上腹部疼痛和黄疸的问题现在不能仅仅通过考虑反流性胆管炎，例如化脓性梗阻性胆管炎和其他疾病来排除。因此，可以去当地的正规医院做普通手术，并进行腹部彩色多普勒超声和电脑断层扫描等检查。例如，如果病人的病情被认为很严重，就需要手术。
多摄取高纤维的食物，如蔬菜、水果、完全谷物等。限制胆固醇的摄取量。绝对不吃内脏、蛋黄等富含胆固醇的食物。避免食用加工食品和高糖分的食物。同时口服些清热解毒、利胆类药物。如果是慢性的毛细胆管炎，可以采用些中草药治疗，中草药主要是以消炎利胆、清热解毒类药物为主，治疗期间清淡饮食。
