胆囊结石且胆囊萎缩应该手术治疗，因为胆囊结石的癌变率大概10%，当胆囊出现萎缩的时候，说明胆囊的功能就不健全了。这时候胆囊既然没有功能，里面又有大量的结石，这样引起癌变几率比较大。
胆囊结石可能是以下原因引起的。
胆囊结石是由多种原因造成的，不管是什么原因造成的，都会导致胆汁的酸性、胆固醇的代谢紊乱，从而导致胆汁在胆囊内沉积，从而导致胆囊内的结石。肥胖、长期暴饮暴食、高脂肪、高蛋白饮食、高脂血症、糖尿病、胃肠道手术、肝硬化等都属于高风险的危险因子。另外，一些年轻人因为不喜欢吃早饭，导致胆囊中的胆汁滞留太久，导致了胆囊结石的发生。
产妇胆囊结石通常可以使用药物来治疗，在产后行手术。
如果怀孕时有胆囊结石，通常不能做胆囊切除手术，因为胆囊切除术是要做全身麻醉的手术，这样会对怀孕产生一定的影响。建议在产妇在生产后再进行外科手术。如果怀孕期间因胆囊结石而出现胆囊炎，可应用抗生素或利胆的药物来控制感染，如感染持续时间过长，且已临近产期，则应在取出胎儿后进行胆囊切除，以控制病情发展。
一般情况下，胆囊结石3-5mm通常需要治疗。具体分析如下：
如果胆囊结石是单发的，而且小于3cm的胆管结石，一般不会有太大的临床表现，通常暂时不用治疗，平时应该注意适当地饮水即可。如果胆囊结石是多发的，而且已经有3-5mm，可能会嵌顿在胆囊颈部，会导致急性胆囊炎、胆囊穿孔、坏疽等并发症，这种情况下患者需要及时就医治疗，以免病情加重，严重损伤身体健康。
孕妇同时患上胆囊结石是一件痛苦的事情，需根据严重程度进行治疗。
如果胆囊结石比较小，症状不明显，可以等到分娩以后再治疗。一般来说，胆结石体积小于1厘米，不会对身体造成影响，有的患者会终身携带，但不会有任何症状。但若是症状较为严重，通常需采取药物或手术的方式进行治疗，避免对身体造成影响，不利于胎儿正常的生长发育。
胆囊结石能治愈。
胆囊结石的治疗方法有以下几种：1、胆囊结石可以通过胆道直接排出，如果胆囊结石不能再发生；2、对于泥沙样的胆囊结石，可以选择消炎利胆类的药物。如果发生胆道阻塞，可以在十二指肠镜下进行胆道切除，以保存胆囊的功能。如果病人平时注意饮食和生活习惯，可以避免反复发作；3、如果胆囊结石持续时间过长，并且反复出现慢性胆囊炎，胆囊收缩功能受到一定程度的影响，可以通过胆囊切除手术来治疗。