可切除的胆管癌，手术治疗为首选的方法，手术切除之后联合全身的化疗及放疗，可以取得较好的预后。对于不可切除的，全身的放疗、化疗仍然是一种有效的治疗手段，进行综合治疗。对于手术不能切除的，如果出现胆道梗阻、黄疸等症状，可以行内镜下的胆道支架置入，或者是经皮的肝内胆道穿刺引流。
手术根治性切除是胆管癌获得长期生存的唯一机会，胆管癌的治疗原则是可切除病例以手术切除为主，术后配合放疗及化疗，以巩固和提高手术治疗效果，对于不能切除的晚期病例，应施行胆道引流手术，以解除胆道梗阻，控制胆道感染，改善肝脏功能，减少合并症，延长生命，改善生活质量。
胆管癌如果在发病初期，可以用化疗的方法进行治疗，如果对化疗敏感，也可以采用放疗，但是较有效的治疗方法还是手术治疗，可采用切除肝门部胆管癌手术，肝门部胆管癌姑息性手术。
阻黄胆管癌选择手术加化疗的办法进行治疗，如果是发现的早，并且是得到了及时的治疗的，那这样的病症治疗之后，可以完全的治好，并且是也不会复发的，如果是晚期的病症，复发的可能性比较大。
胆管癌的治疗采取化疗和手术治疗。对不可切除和转移的胆管癌经胆道引流后，应用放射治疗和药物，将白细胞抽一部分在体外做培养增强，用免疫抗原的办法增强，提升它的免疫力，再给它回缩回去，也可切除肝门部胆管癌手术，肝门部胆管癌姑息性手术，中下部胆管癌切除术。
可以采用无创保肝取石，在ERCP内镜的基础上研制出的一种高新胆管内镜系统，在ERCP内镜基础上，采用十二指肠大乳头球囊扩张胆管出口，将ERCP纤维内镜送入胆总管内，通过胆总管直达肝内胆管，通过肝内胆管球囊扩张肝内胆管，扩开肝内胆管内径，通畅取石通道，可以一次性彻底清除肝内胆管结石，手术全程在视频可视下内镜操作，无痛、无创伤、无出血，一次彻底治愈肝内胆管结石，保住正常的肝脏组织。
