由于患者个人体质差异和病情情况，疣体用什么药最好需根据实际情况来判断。
因为常见的是寻常疣、扁平疣、跖疣、尖锐湿疣、疣状表皮生长不良等，可在医生指导下使用维A酸乳膏、氟尿嘧啶软膏、酞丁胺霜、咪喹莫特乳膏等。但效果因人而异，并无最佳效果的说法。
长有疣体的患者，可遵医嘱选用维A酸类，抗病毒类等药物治疗。
1、维A酸类：常用有维A酸乳膏等、他扎罗汀的乳膏，主要通过调控角质细胞的分化、抗增殖并起作用。
2、抗病毒类：含重组人干扰素α2b软膏等、盐酸左旋咪唑搽剂、鬼臼毒素酊等，主要通过对病毒复制的抑制作用来实现。
去除疣体可以在医生的指导下使用咪喹莫特软膏、水杨酸软膏、氟尿嘧啶软膏等药物来做改善。
1.咪喹莫特软膏：咪喹莫特软膏属于非核苷类异环胺类药，具有抗病毒的功效，有一定的腐蚀性。
2.水杨酸软膏：水杨酸软膏的主要成分是水杨酸，具有溶解角质的效果，同时还具有一定的腐蚀性，能够达到腐蚀疣体的作用，可以帮助疣体尽快脱落。
3.氟尿嘧啶软膏：氟尿嘧啶软膏可起到消炎和杀菌的作用，同时还具有抗病毒的效果，通常能够用于治疗各种疣体疾病，比如尖锐湿疣、扁平疣、寻常疣、丝状疣等。
衣原体用大环内酯类抗生素效果比较好。
大环内酯类抗生素对衣原体比较敏感，患者感染衣原体后，可以遵医嘱使用阿奇霉素、罗红霉素等药物进行治疗。除上述药物外，患者还可遵医嘱使用四环素进行治疗，也可以选择喹诺酮类药物，例如莫西沙星、盐酸左氧氟沙星等。
男性支原体用抗生素类药最好。
男性病人因支原体感染而出现的病症，在临床上也很常见。一般是由于病人的免疫力下降，以及被支原体感染所致。而阿奇霉素或罗红霉素等抗生素类药是治疗支原体感染的首选药物。经过这几种药物的治疗，一般的支原体感染都会很快被控制住，患者的身体也会快速的康复。
脚上疣体通常建议使用咪喹莫特乳膏、酞丁安乳膏、维A酸乳膏等。
脚上疣体一般是跖疣，由于皮肤破损、摩擦、足部多汗等因素，导致人乳头状瘤病毒从破损处侵入，感染足底皮肤表皮细胞，使其异常分化和增生，形成皮肤良性增生物。建议出现不适症状后及时就医，在医生指导下用药。