脂肪肝是可以引起甲胎蛋白升高的，任何情况下，只要能够引起肝功能损伤都有可能出现甲胎蛋白升高的现象，如果甲胎蛋白没有持续性明显升高，是没有诊断肿瘤的临床意义的。
孕妇甲胎蛋白偏高的治疗方法如下：
女性在怀孕后出现甲胎蛋白偏高的原因可能是因为怀孕后,胎儿体内会产生甲胎蛋白,这是人体在胚胎时期血液中含有的一种特殊蛋白。正常情况下，会在孕期中期会逐渐恢复正常，不必过于紧张担忧。必要时，及时去医院进行检查，在专业医生的指导下进行对症治疗。另外，在孕期，孕妇需要定期去医院进行产检，观察胎儿的发育状况。
一般正常人血清中甲胎蛋白的含量不到20μg/L，但当肝细胞发生癌变时，却又恢复了产生这种蛋白质的功能，据调查发现约有80%的肝癌病人血清中甲胎蛋白会升高，通常以400μg/L为标准，高于此数值应该考虑肝癌的可能性，一般在肝癌出现症状之前的8个月甲胎蛋白就已经升高。
一般来说，如果孕妇患有急慢性肝炎，或者肝硬化，甚至胎儿神经管缺陷，或者胎儿脊柱裂等缺陷，都会造成孕妇甲胎蛋白偏高。建议及时治疗。
甲胎蛋白是新生的幼稚肝细胞分泌的，而胎儿肝细胞还没有发育完全，所以会分泌大量的甲胎蛋白。如果女性在怀孕期间甲胎蛋白水平较高，但不超过400ug/L，通常被认为是正常的生理表现。
肝囊肿是不会导致甲胎蛋白升高的，甲胎蛋白是原发肝癌的肿瘤标志物，像肝炎，肝硬化，也可能引起甲胎蛋白升高，所以可以进一步的检查身体，看看身体是否还有其他的肝病症状。
如果甲胎蛋白大于400ng/mL，而且持续八周以上，并且能排除活动性肝炎，妊娠，胚胎肿瘤史，则支持肝癌的诊断。但是，也有15%-20%的肝癌，血清甲胎蛋白可以在正常范围。另外，一些良性肝脏疾病的甲胎蛋白也可能升高，例如肝炎，肝纤维化，肝硬化等。
