多发性肾结石可以通过手术进行治疗。感染性肾结石最常见的就是外科治疗，因此，一旦诊断出肾脏结石，要尽可能的进行外科治疗，但是要知道，外科治疗也有一定的适应症，肾结石的病人要知道这一点。对于那些在短时间没有排出的肾脏结石，如果肾脏的直径小于0.8cm，可以考虑用药，但是如果是肾脏的功能比较好，而且不会出现明显的炎症，如果结石的体积大于1cm，建议立即进行外科治疗。
多发性肾结石是比较严重的，多发性肾结石首先要看结石的大小和位置，如果结石很大或者卡在了输尿管等地方是可以造成肾积水的，严重的还会对肾脏功能造成伤害，所以肾结石是需要引起重视的。
多发性肾结石的治疗主要取决于结石的大小及位置。对于较小的肾结石，直径小于6mm，可以通过口服药物，配合运动及多饮水，多数可排除。对于结石大于6mm，小于20mm的结石，可以通过体外震波碎石排出、经皮肾镜切开取石术及支架等治疗。但对于大的多发性结石或鹿角样结石，可以通过经皮肾镜切开取石术或外科手及配合溶石药物治疗。
双肾多发性肾结石可以通过以下方式进行治疗。
一，结石具体部位结石有多大、结石数量，肾是否正常，根据对以上情况的认识，做出处理上的抉择。如果结石没有位于肾盂和肾盏中，可以不进行治疗，石低于0.5厘米的，应进行排石治疗，结石在0.5~1.5厘米之间时，可用体外震波碎石。当结石大数量较多或者肾功能不佳时，选择手术，体外震波碎石处理是损伤很小的处理手段，把结石震碎，靠尿流排除，治疗痛苦少，通常都可以忍受，一排石需要尿液清洗，需要具备良好肾功能。
日常生活注意，一天的饮水量约为三千毫升，不宜喝果汁，茶和碳酸饮料等，以免含钙过高、限制食盐和糖的高草酸盐膳食。
如果是多发肾结石，必须要先做一个腹部B超。确定一下结石的大小，如果结石比较大，可以用体外碎石，如果结石比较小可以口服排石颗粒，可以采用经皮肾镜、输尿管镜取石术等微创手术，把大石头打碎了，再进行药物排石治疗。
