有副作用的，副作用是由于牙髓组织被清理，牙齿的脆性会增加，坚固度降低，在做完根管治疗后，通常需要制作一个假牙冠用来保护该牙齿，根管治疗是牙髓炎疼痛以及根尖周炎首选的治疗方法。
根管治疗后的牙齿可以在几年，甚至十几年的时间里都不会出问题，有特殊的情况会导致牙齿折裂，是因为根管治疗是去除牙齿根管内和髓腔内的神经和牙髓组织，牙髓位于牙髓腔内，包含了神经、血管和淋巴组织，具有形成牙本质，为牙体提供营养，以及感觉和防御能力。
一般情况下，小孩乳牙做根管治疗通常是较好的。不注意口腔卫生、牙齿发育异常等因素可能诱发乳牙牙髓炎，小孩多有牙痛的症状，可能还会在细菌感染的影响下出现红肿、牙周膜增宽、牙槽骨吸收等症状。此时，及时给小孩乳牙做根管治疗有助于消除疼痛，避免细菌进一步感染，避免诱发颌面部蜂窝组织炎，以保证小孩恒牙的正常萌出。
做完根管治疗后，会有术后反应期，3-5天、一周甚至1个月，术后反应期出现疼痛为正常现象。但是如果疼痛出现在根管治疗后几个月或者几年，很有可能是当初进行根管治疗时并不完善，需要重新进行根管治疗。
根管治疗后在近期会有牙的不适感，有胀痛，是正常的，通常是由于在根管治疗时将牙齿根管扩大直径，这时容易产生胀痛、不适，如果根管治疗后很久，几年以后仍然出现牙齿疼痛，是不正常的，如果根管治疗很久后出现疼痛，通常是由于牙齿牙根部出现劈裂，或者也有可能是遗漏了根管，这时才发作，有可能会出现持续性疼痛或者冷热刺激性疼痛，可以拍CBCT进行检查，必要时需要做根管再治疗术或者拔除牙齿。
根管治疗过程中需要做临时牙套，一般完成治疗需要2到3周时间，之后需要做一个永久的牙套，不过放心，套上牙套不会难受，用起来也和自己牙齿差不多的美观上也和自己的牙齿一样。
