慢性自身免疫性甲状腺炎可以通过口服药物进行治疗。慢性自身免疫性甲状腺炎是很常见的一种甲状腺疾病，发病机制是由于体内免疫系统异常导致甲状腺出现问题。
甲状腺炎怎么治，要看甲状腺炎种类及甲状腺功能。
一般除了急性甲状腺炎要用抗生素外，其他甲状腺炎不需抗生素治疗。甲亢病人一般不需抗甲亢药，但有少数病人需长期用药。甲状腺功能恢复正常，没有明显的压迫症状，一般可随诊随看，不需处理。当发现有严重压迫症状时，应及时进行手术切除。如增大的甲状腺对邻近器官有压迫作用，也可影响外形，可以吃激素类药物，让腺体变小。如果患者有慢性活动后乏力或疲劳等表现时，应考虑是否患有甲状腺疾病，并及时就医检查，以明确诊断及选择合理治疗方法。普通甲状腺炎所致甲状腺机能亢进无需手术及碘-131。
甲状腺炎多由于细菌，真菌以及邻近周围器官炎症蔓延引起，早期表现为红，肿，热，痛需给予抗菌素治疗。甲状腺炎早期表现为甲亢等高代谢症候群，多采取对症治疗，如发烧给予解热镇痛治疗，甲亢症状给予β受体阻滞剂治疗。病情较重，病程较长者，给予糖皮质激素进行治疗，但不作为首选。甲状腺炎症性疾病，均可进行结合治疗，通过改善甲状腺激素分泌，促进甲状腺功能恢复。
甲状腺炎的种类较多，其治疗需要对症处理，主要有以下几种方法：
1、急性甲状腺炎：因为细菌感染，局部的甲状腺化脓，伴有发烧，以消炎治疗为主，如果有化脓，可以局部切开引流；
2、亚甲炎：往往继发于病毒感冒以后，典型的症状是甲状腺或颈部的疼痛，伴有发热，严重的患者可以采用激素治疗，但是对于一般的患者，不采用激素治疗，对于发热超过38.5℃以上的患者可以进行退烧，疼痛的患者可以用止疼药治疗，在亚甲炎的治疗上，中医治疗比较有优势，可以在早期使用清热解毒的中药治疗，对病情的缓解有明显的益处。
亚甲状腺炎可以通过使用非甾体抗炎药或糖皮质激素来治疗，具体内容分析如下：
亚甲状腺炎的治疗需要根据患者的症状来决定。对于甲状腺疼痛、高热等症状不明显的患者，可以服用一些非甾体抗炎药，如布洛芬、吲哚美辛等。但剂量过大时，要注意防止非甾体抗炎药对胃黏膜的影响，可加入胃黏膜保护剂。对于高热、甲状腺区疼痛明显的患者，可考虑使用糖皮质激素(如泼尼松)进行治疗，对改善症状有效。但需要注意糖皮质激素的逐渐停药和糖皮质激素的不良反应。
甲状腺炎合并甲减可以通过药物进行治疗。
甲减与甲状腺炎合并甲减的区别在于，根据不同的甲状腺炎所引起的甲减，治疗的原则也是不一样的。就拿亚急性甲状腺炎来说，甲减是一种暂时性的，不需要优甲乐替代治疗，等过一段时间，甲状腺功能就会恢复正常。如果是自身免疫性甲状腺炎，那么就是终生性的甲减，终身服用优甲乐来代替治疗，主要是为了保持甲状腺功能在正常范围内，在任何情况下都不能停药。
