可以通过药物、手术等方式治疗甲亢突眼症。
对于突眼的药物治疗，可以选择强的松等皮质激素，但作用缓慢，病程长，副作用也多。还有一些其它的免疫抑制剂，比如环磷酰氨，也可以起到一定的效果，不过副作用会比较大。除此之外，云克治疗也可以用来改善突眼的症状，但是效果并不是很好。对严重的突眼症可以通过外科手术来进行治疗，但其效果并不明确。对于突眼症较严重的患者，可以采取其它的治疗措施，以减轻眼窝内的压迫，并配合换血疗法。
甲状腺机能亢进是甲状腺激素分泌过多引起的一种内分泌疾病，甲状腺机能亢进的突眼，要以治疗甲亢为主。当甲状腺机能亢进被控制到一定程度时，会消失。平时注意饮食清淡，多进行体育锻炼，多吃蔬菜水果。
中医治疗甲亢突眼一般效果不错。
甲亢又称甲状腺功能亢进。多食、消瘦、畏热、多汗、心悸、激动等高代谢症候群，神经和血管兴奋增强，还会出现不同程度的甲状腺肿大、眼突、手颤、胫部血管杂音等症状，建议去正规的医院做进一步检查，对症治疗，可以通过中医或者西医进行治疗，一般能有效地缓解病情。患者还可以按照医嘱使用甲硫氧嘧啶片、甲巯咪唑片等药物进行治疗。
眼睛勿向上凝视、高枕卧位、限制钠盐摄入等可预防甲亢眼突。
眼睛向上凝视会加剧眼球突出和诱发斜视。眼睑不能闭合的患者须注意保护角膜和结膜，防止干燥、外伤及感染，外出戴墨镜或用眼罩以避免强光、风沙及灰尘的刺激。高枕卧位和限制钠盐摄入，可减轻球后水肿，改善眼部症状，每日做眼球运动以锻炼眼肌，改善眼肌功能。患者可食用大豆、芹菜、卷心菜等，有利于缓解病痛。
甲亢突眼能否治好关系到突眼轻重，若为良性突眼通常经过免疫抑制剂、高剂量激素冲击和眶后减压后即可痊愈。
若为恶性突眼则通常难以完全恢复。建议病人应主动就诊并使用抗甲状腺药物。
平时注意护眼、忌熬夜、出门带墨镜。此外，还应注意在生活中饮食调养，多吃含蛋白质、维生素和微量元素较多的食品，例如新鲜蔬菜，水果和豆制品，以利于人体新陈代谢。
甲亢突眼的治疗主要有糖皮质激素，可以口服静脉甲强龙冲击，效果非常好，在临床上也有很多的应用，不过也有很大的副作用，比如血压，血糖不正常，血钾不足。对于患有甲状腺功能障碍的患者，可以采用球后放疗、眼窝减压等方式来进行治疗。甲亢突眼要尽早调整到正常状态，甲亢突眼很有可能会在甲亢前或是甲亢后发生，需要及时治疗，不要延误治疗时间。
