肾结石的初期是不太明显的，可能会有轻微的腰酸。是要及时的进行肾脏彩超的检查，尿常规的检查，以便确定是否有尿中红细胞的存在，通过B超可以检查结石的大小，如果结石比较小，可以应用排石药物配合合理的运动来促进结石排出体外。
结石大致分为胆囊结石和肾结石，慢性期结石无明显症状，急性发作期可表现多种不适，比如胆囊结石急性发作时除上腹部疼痛外，还有恶心、呕吐、发热、厌油腻、腹胀等症状，部分还会出现身体皮肤发黄的情况。肾结石常常伴有肾区叩击痛，剧烈绞痛，血尿，面色苍白，严重时可有头晕、血压下降以及恶心、呕吐、腹胀等消化系统症状。
肾结石的症状与结石是否活动有关，如果肾结石在肾盂里固定不定时，一般没有任何不适症状；肾结石在肾脏里活动，或者顺着尿液往外排，且卡在输尿管的某处，此时可出现剧烈的肾绞痛，可以向大腿内侧放射，并伴有尿频、尿急的症状，甚至出现一过性肉眼血尿，还可能出现全身大汗、恶心呕吐等迷走神经兴奋的症状。
绝大多数的肾结石是没有什么症状的，特别是在肾脏实质内的结石是没有症状的。只有一少部分肾结石病人，有时会出现结石一侧有腰腹部酸痛。当肾结石排出，并嵌顿到肾盂与输尿管的移行部，就是交界处，就会发生腰腹部绞痛，并且伴有恶心、呕吐以及腹胀。
肝结石是比较常见的肝胆疾病，其主要症状有上腹部疼痛：可表现为典型胆绞痛或持续性胀痛，有的病人疼痛不明显，而寒战发热非常厉害，周期性的间歇发作是肝内胆管结石的特征性临床表现。可有长期的胆道病史、或伴有寒战发热、黄疸的急性胆管炎史；患侧肝区及下胸部有经常性疼痛不适，常放射至背、肩部。
结石由尿管排入膀胱，明显的症状就是腰痛减轻或者消失。因为结石位于肾脏输尿管之内，会造成局部梗阻而导致肾脏积水、输尿管扩张，这时会产生肾区的疼痛或者腹部的疼痛。但当结石掉入输尿管后，则梗阻解除，肾脏产生的尿液可以顺利的流入膀胱内，所以腰痛、腹痛的症状会立刻减轻，甚至完全消失。
