扁桃体结石臭是因为扁桃体慢性、长期发炎导致扁桃体隐窝长期处于阻塞状态，分泌物引流不畅导致上瘾窝里存在上皮细胞脱落、白细胞、淋巴细胞、分泌物、食物残渣混在一起以及不易溶解的钙、镁等无机盐的沉积形成结石。
扁桃体结石不严重，但是扁桃体结石会引起病人扁桃体胀痛、口臭、反复发炎等相关症状。扁桃体结石是由于长时间的辛辣刺激食物的摄入，不注意口腔卫生，从而导致扁桃体分泌物无法排出体外，在扁桃体上隐窝口处形成结晶，从而形成嵌顿。
扁桃体结石多发生于扁桃体上隐窝中，由于长期阻塞，分泌物引流不畅，干酪样物积聚，导致不易溶解的钙、镁等无机盐沉积而形成结石，小结石可用无菌刮匙或者钳子挖出，而大结石则需在表面麻醉下切开黏膜取出。
扁桃体结石不严重，解决办法是要适当采用一些含化药物，结石的原因也可能与反复感染有关系。如果是经过一般处理和含化药物处理，效果不好，要及时到耳鼻喉科就诊。
扁桃体结石是不会癌变，是上皮过度角化的疾病。扁桃体结石是扁桃体的一个慢性疾病，同时可伴有其他咽喉部黏膜的结石。扁桃体结石，主要是由于扁桃体的急、慢性炎症，导致扁桃体隐窝处的上皮过度角化，局部所形成的一种尖锐的沙粒状物，附着在扁桃体表面。
