眼肌型重症肌无力诊断一旦确立，为了更好的判断和提高疗效，必须做出治疗前基础肌力的评价，要尽量去除干涉治疗的因素，保证取得最佳的疗效。应注意有无其他免疫性疾病与重症肌无力相伴随，如甲状腺炎、红斑狼疮、皮肌炎等有无加重肌无力情况的存在，还有就是干扰治疗的疾病。治疗的药物以免疫抑制剂为主，还有血浆交换都可以改善患者肌无力的症状。
可以用药物来治疗或者是食物控制。眼肌麻痹性偏头疼，又称眼肌瘫痪性偏头疼。是一种反复发作的眼外肌麻痹和偏头疼为主要特征的综合征。这种偏头疼原发于眼部与中枢神经系统有关。病因目前尚不清楚，多数人认为就是跟血管功能紊乱，血管收缩，脑血管畸形或者肿瘤等原因有关。
一般情况下，儿童重症肌无力眼肌型这种病不能治愈。
这种病是一种获得性自身免疫性神经肌肉接头疾病，临床上最典型的表现就是肌肉无力，重症肌无力是一个慢性疾病，在患病过程中可以出现病情的缓解和加重的情况，有一些患儿可以经过数月或者数年的时间自然缓解。但大部分患儿病情会持续到成年，所以对于这种疾病的患者需要长期药物治疗。
可以选择针灸治疗重症肌无力眼肌型针灸的位置有很多，例如攒竹透睛明、鱼腰、瞳子寥、四白穴、承泣穴、球后穴还有养老穴等都可以作为治疗重症肌无力眼肌型的针灸穴位。针灸主要是先通过辨证分析病情，再选择针灸位置。比如如果属于脾虚湿阻型，则可以选择远端补肾的穴位来进行治疗。
早期在常规治疗后可痊愈而不复发。但治疗前应特别注意检查方法。血、尿、便、脑脊液检查正常。根据检查报告合理治疗，治疗后无复发。需长期口服药物。可在正规医院神经内科检查治疗。
单纯眼肌型的重症肌无力，是指重症肌无力受累肌群只局限于眼部的肌肉，表现为提上睑肌和眼外肌的运动障碍，比如睁眼看东西的时候，看着看着提上睑肌无力，眼皮掉下来了。闭上眼睛休息一会，眼皮又能睁开，持续的时间越来越短。病情往往比较轻，口服免疫抑制剂，疗效可能比较好。
