如果囊肿非常小，没有引起临床症状，尤其是没有垂体激素水平下降的症状，一般不需要进行治疗，但一定要注意密切随访，定期复查。主要是根据囊肿的大小和临床症状，进行针对性治疗。
通常来说，垂体性甲减需要治疗，具体分析如下：
建议患者口服甲状腺素片以维持血液中的浓度，修复甲状腺的正常功能。一部分垂体性甲减患者需终身吃药，一部分患者可在清除发病原因后断药。服用左甲状腺激素时患者需要定期复查甲状腺功能，随时随地调节服药剂量，同时注意进高维生素、高营养饮食，避免吃油腻辛辣刺激性的食材。
垂体腺瘤一般需要治疗。
垂体腺瘤是一种由垂体内的腺体所引起的一种肿瘤。垂体瘤99%都是由垂体腺瘤引起的，除了垂体腺的肿瘤之外，还有垂体下的脑部也有可能出现这种情况。垂体瘤可以通过药物治疗、放射治疗和外科治疗来治疗，一般都是通过鼻外科进行微创手术，大多数情况下都能完全去除，相对来说比较保险，但是术后要注重鼻腔的防护和日常的膳食。
脑垂体增大可以密切观察，如果病情严重需要进行手术治疗。
大脑垂体变大需要根据患者的临床表现来确定，如果只是生理上的增长并没有特别明显的临床表现，那么可以先不进行手术观察。而当大脑垂体变大时，这种情况就是一种疾病导致的，有很大的几率会出现垂体瘤，这种情况下就必须通过外科手术，通常采用鼻蝶入路进行垂体瘤的切除。
脑垂体萎缩可以通过药物进行治疗。
脑垂体萎缩是一种引起垂体的功能下降的疾病，这种疾病会影响到垂体相应的激素水平，在治疗的时候，要先消除病因，然后再进行靶腺激素的长期替代治疗。比如垂体功能低下的第一步是补充肾上腺皮质激素，其次是肾上腺皮质激素，然后是甲状腺激素，可以从低剂量逐渐增加，如果是年轻的，可以进行性激素的补充。
治疗要明确是那种疾病再进行治疗，可以到正规医院内分泌科或外科就诊检查，根据病情采取激素类药物、手术、放疗等方法治疗。甲状腺-肾上腺皮质激素、性激素替代疗法，适用于全垂体功能衰退引起的多腺体功能减退者。垂体性闭经-手术和放射疗法垂体性闭经-食疗。
