一般情况下，谷氨酰转移酶升高的话，表示肝细胞有损害，肝功能受到影响了。内科疾病有脂肪肝、酒精肝、肝硬化以及心肌疾病、肾脏疾病、免疫系统疾病，这些疾病都可以造成肝脏内源性的问题，导致谷酰转肽酶升高。
当然也有一些外科疾病，包括胆道梗阻、胆道结石，胆道肿瘤、肝脏占位性病变，以及一些肿瘤的晚期，都能够造成谷氨酰转移酶的偏高。
胆红素是由胆汁生成障碍或/和胆汁流动障碍所致的一组疾病共同的临床症状，又名胆汁淤积综合征。对肝内胆汁淤积，还要明确是遗传性还是获得性，遗传性胆汁淤积的识别是基于排除获得性病因，一般应当做肝穿刺以探索肝实质性病变。
导致Y-谷氨酰基转移酶偏高的原因比较多，可以分为生理和病理另个方面，生理方面的一般就是饮酒、熬夜、激烈运动、服用药物等所致，通过一段时间的休息调养就能，病理方面的就是肝脏炎症了，需要进行治疗。
可能与长期大量酗酒有关，长期酗酒还容易引起酒精肝，对肝功能造成损伤，也可能是饮食不当引起脂肪肝导致的，体内脂肪堆积过多，谷氨酰氨转移酶是检测肝脏功能是否正常的一项重要指标，正常参考值在3~40u/l，偏低说明肝功能异常。
不能仅凭谷氨酰转肽酶的数值来判断疾病的严重程度，有些谷氨酰转肽酶数值达到200并不严重，经过治疗后完全能够康复，而有些谷氨酰转肽酶的数值达到200，有可能是乙肝、肝硬化甚至是原发性肝癌、胆管癌等恶性肿瘤所致成的。这些疾病都是比较严重的病变。
新生儿谷氨酰转肽酶偏和总胆红素偏高主要见于肝胆疾病，具体原因如下：新生儿出生时误吸少量羊水或因为其他感染性原因，导致新生儿患有肺炎，可造成谷氨酰转肽酶升高；若新生儿有胆道梗阻，由于先天性的胆道闭锁，引起人体的胆汁不能排泄，造成新生儿黄疸，检查肝功能相关指标时可能会出现谷氨酰转肽酶偏高。
